<div dir="ltr">On Thu, Dec 19, 2013 at 7:08 AM, Scott Horowitz <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:horowsah@umich.edu" target="_blank">horowsah@umich.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Well, while we&#39;re on this topic, I was just starting to try phenix-rosetta on a mac, and after following the instructions online I get this error message:<div>

<br></div><div><div>...</div><div>� File &quot;//Applications/PHENIX-1.8.4-1496/Contents/phenix-1.8.4-1496/cctbx_project/cctbx/xray/structure_factors/manager.py&quot;, line 234, in __init__</div>

<div>� � assert xray_structure.space_group() == miller_set.space_group()</div><div>AssertionError</div></div></div></blockquote><div><br></div><div>Your PDB file and your data file have different space groups - usually this means that either the PDB file is missing symmetry entirely and gets treated as a P1 box, or the PDB file specifies the screw axes while the data file only specifies the point group (for instance, P212121 versus P222). �This is something we normally try to handle more automatically but the input handler for the Rosetta refinement is somewhat less flexible at the moment. �I&#39;ll fix this, but it should run okay if you ensure that the space group is unambiguously specified in both files.</div>

<div><br></div><div>-Nat</div></div></div></div>