<div dir="ltr">Quick update: I&#39;ve added an increment_resseq option that does what you want; it will be in the next build.<div><br></div><div>-Nat</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Wed, Feb 26, 2014 at 11:23 PM, Nathaniel Echols <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:nechols@lbl.gov" target="_blank">nechols@lbl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">I don&#39;t think pdbtools has this right now, although it can probably be added with minimal effort.  If you&#39;re willing and able to edit your model interactively, phenix.pdb_editor is much more flexible (but it&#39;s a GUI, so not suitable for automated use).<div>


<br></div><div>Of course I&#39;m pretty sure Coot can do this too.</div><div><br></div><div>-Nat</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote"><div><div class="h5">On Wed, Feb 26, 2014 at 9:21 PM, Rojan Shrestha <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:rojan@riken.jp" target="_blank">rojan@riken.jp</a>&gt;</span> wrote:<br>


</div></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div class="h5"><div style="font-size:14px;font-family:Calibri,sans-serif;word-wrap:break-word"><div>

Hello,</div><div><br></div><div>I have found the program phenix.pdbtools. Maybe, it can renumber residues of pdb. I have found the options <b>renumber_residues</b> options but I am unable to see the options for starting residues.</div>


<div><br></div><div>I have pdb starts from 1 and want to renumber 1 into 250. Can somebody tell me how to put the option for starting residue?</div><div><br></div><div>Regards,</div><div><br></div><div>Rojan </div></div>


<br></div></div>_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>
</blockquote></div><br></div>