
<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body ocsi="0" fpstyle="1">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Hello all-<br>

<br>

I am trying to merge a few partial Se datasets. I am certain that I will have to reindex one or more to make sure that &#43; and - reflections are not jumbled up. Can someone confirm that xtriage take this into account in suggesting to reindex one dataset in relation

 to a reference dataset? ie. does it use something like maximizing the anomalous signal in suggesting whether or not reindexing is necessary? I think the below suggests as much but I wanted confirmation:<br>

<br>

Automatic re-indexing<br>

For each data set supplied (other than the first data set given), all possible re-indexing matrices are derived as described by Grosse-Kunstleve et al. (2005). Each data set isautomatically re-indexed using the matrix that maximizes the correlation of amplitudes<br>

<br>

Have a good weekend.<br>

-Todd<br>

<br>

<br>

<br>

My Example:<br>

Reference analyses<br>

&nbsp;&nbsp; The following reindexing operators have been found:<br>

<br>

-------------------------------------------------<br>

| Operator | Correlation | matches (%) | choice |<br>

-------------------------------------------------<br>

| -k,h,l&nbsp;&nbsp; | 0.874&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 70.1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp; &lt;---&nbsp; |<br>

| h,k,l&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 0.032&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; | 76.7&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; |<br>

-------------------------------------------------<br>

<br>

If the data is reindexed with operator (-k,h,l), the correlation of<br>

the intensities to the reference data is maximized. <br>

sx205b_anom.sca<br>

This can be done for instance with:<br>

&nbsp; phenix.reflection_file_converter sx205b_anom.sca --change_of_basis=&quot;-k,h,l&quot; &lt;output_options&gt;

<br>

</div>

</body>

</html>