<div dir="ltr">On Tue, May 13, 2014 at 6:34 AM, Mark A Saper <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:saper@umich.edu" target="_blank">saper@umich.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">

Your suggestion of setting the alt-loc the same for the two residues in order to avoid the non-bonded contact restraint is not working yet.<br></blockquote><div><br></div><div>The same, or different?  Atoms with identical altlocs will always interact with each other (and atoms with blank altlocs).</div>

<div><br></div><div>-Nat </div></div></div></div>