<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
<div>Hi Derek et al. -&nbsp;</div>
<div><br>
</div>
Since, as Nat (Echols) mentioned, Phenix does expand the paths, you’ll have to do the linking the other way around (i.e. the actual files are in /a/my_project, and the link is ~/Dropbox/a/my_project =&gt; /a/my_project). &nbsp;Then as long as the /a/my_project path
 is the same on all three computers, it should be fine—Dropbox&nbsp;<a href="http://www.dropboxwiki.com/tips-and-tricks/sync-other-folders">follows symlinks</a>&nbsp; &nbsp;I have several directories linked this way, with the original files outside the Dropbox folder on each
 computer, although, I admit I haven’t done it with Phenix.
<div><br>
</div>
<div>
<div>To set it up on an additional computer, you should allow Dropbox to download all the files locally, pause Dropbox syncing, move the directory to the root location, create the symlink, then resume Dropbox syncing.</div>
<div><br>
</div>
<div>As for guarding against having multiple instances modifying the files simultaneously: I know I’m presented with a warning if I try to run multiple instances of Phenix on the same machine, but there doesn’t appear to be anything like that to prevent concurrent
 access to a project directory by multiple instances of Phenix on different machines. Assuming network connectivity for all machines and a fast-enough Dropbox sync (which may or may not be a reasonable assumption), it could be sufficient to place a simple lockfile
 in the .phenix directory of the project, perhaps with a username and date/time, and if another user (or the same user on a different machine) tries to open the project, Phenix would present an alert message with info about who locked the project and when,
 along with the option to abort or override the lock. &nbsp;Just thought I’d throw that idea into the ring, in case it might not be too difficult to implement.</div>
<div><br>
</div>
<div>Cheers,</div>
<div>Jared</div>
<div><br>
<div>
<div apple-content-edited="true">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
--<br>
Jared Sampson<br>
Xiangpeng Kong Lab<br>
NYU Langone Medical Center<br>
<a href="http://kong.med.nyu.edu/">http://kong.med.nyu.edu/</a><br>
<br>
</div>
</div>
<br>
<div>
<div>On May 16, 2014, at 11:09 AM, Nathaniel Echols &lt;<a href="mailto:nechols@lbl.gov">nechols@lbl.gov</a>&gt; wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">On Fri, May 16, 2014 at 7:42 AM, Edward A. Berry <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:BerryE@upstate.edu" target="_blank">BerryE@upstate.edu</a>&gt;</span> wrote:<br>
<div class="gmail_extra">
<div class="gmail_quote">
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
(Hope Phenix doesn't automatically resolve the path to full path)<br>
</blockquote>
<div><br>
</div>
<div>Well.... yeah, it does. &nbsp;Which mostly reflects my particular work style and environment rather than any rational design. &nbsp;A number of people have complained about this in the past, but the reason that it hasn't been fixed yet is that it's somewhat difficult
 to avoid completely. &nbsp;However, an update of Phenix for the bold new era of cloud computing is probably overdue; I'll see if I can deal with it this summer. &nbsp;I should also mention, however, that when you have multi-user (or multi-computer) projects it is also
 difficult to prevent different instances of Phenix from conflicting.</div>
<div><br>
</div>
<div>-Nat</div>
</div>
</div>
</div>
_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb<br>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>

<html>
<body>
------------------------------------------------------------<br />
This email message, including any attachments, is for the sole use of the intended recipient(s) and may contain information that is proprietary, confidential, and exempt from disclosure under applicable law. Any unauthorized review, use, disclosure, or distribution is prohibited. If you have received this email in error please notify the sender by return email and delete the original message. Please note, the recipient should check this email and any attachments for the presence of viruses. The organization accepts no liability for any damage caused by any virus transmitted by this email.<br />
=================================
</body>
</html>
</body>
</html>