<div dir="ltr"><div><div><div><div>Hi everybody!<br>Everytime when I (within coot) do &quot;real space refine&quot; two arginines that have two alternate conformations ..(interacting by hydrogen bonds); and then phenix.refine everything, both conformers move away. Therefore, when I open my mtz and pdb files from phenix.refine in coot, I&#39;ll have green blobs where there should be guanidium groups.<br>

<br></div>Can I tell phenix.refine not to move only those two residues?<br><br></div>It should be something like the following lines in the eff file?<br>sites {<br>      individual = None<br>      torsion_angles = None<br>

      rigid_body = None<br></div>      remove_selection=resid 45<br></div>      remove_selection=resid 68<br><div><div>}<br><br></div><div>Thank you very much<br></div></div></div>