<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:x="urn:schemas-microsoft-com:office:excel" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:SimSun;
        panose-1:2 1 6 0 3 1 1 1 1 1;}
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:"\@SimSun";
        panose-1:2 1 6 0 3 1 1 1 1 1;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri","sans-serif";}
@page WordSection1
        {size:8.5in 11.0in;
        margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-US" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Dear Colleagues,<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal">I am refining a structure and there is a SO4 on the 3-fold axis. What I did was to put atom S and O1 on the 3-fold with occ=0.33, and O2 with&nbsp; occ=1, and no O3 and O4 in the pdb (O3 and O4 will be the symmetry of O2). But when I refine
 it, Phenix complains close non-bounded distances for both S and O1. Is there a way to refine this sulfate? Thanks!<o:p></o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Best regards,
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Tongqing<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D"><o:p>&nbsp;</o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><b><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Tongqing Zhou, Ph.D.<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Staff Scientist<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Structural Biology Section<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Vaccine Research Center, NIAID/NIH<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Building 40, Room 4609B<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">40 Convent Drive, MSC3027<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">Bethesda, MD 20892<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">(301) 594-8710 (Tel)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">(301) 793-0794 (Cell)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#1F497D">(301) 480-2658 (Fax)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#A6A6A6">******************************************************************************<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#A6A6A6">The information in this e-mail and any of its attachments is confidential and may contain sensitive information. It should not be used by anyone who is not the
 original intended recipient. If you have received this e-mail in error please inform the sender and delete it from your mailbox or any other storage devices. National Institute of Allergy and Infectious Diseases shall not accept liability for any statements
 made that are sender's own and not expressly made on behalf of the NIAID by one of its representatives.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-family:&quot;Arial&quot;,&quot;sans-serif&quot;;color:#A6A6A6">******************************************************************</span><span style="color:#A6A6A6"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p>&nbsp;</o:p></p>
</div>
</body>
</html>