<div dir="ltr">Hi Pavel,<div><br></div><div>Thank you, I have also tried COOT but I wanted to know whether anyone had used (with success ) other similar tools.</div><div><br></div><div>Why? Mostly curiosity :) but also to do a comparison I guess of performance.</div>

<div><br></div><div>Thank you, I will check some of the others you have mentioned.</div><div><br></div><div>George</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jul 28, 2014 at 9:29 AM, Pavel Afonine <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:pafonine@lbl.gov" target="_blank">pafonine@lbl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi George,<br>
    <br>
    as far as I know phenix.real_space_refine is the only user-exposed
    real-space refinement utility in Phenix. You can think of Tom&#39;s
    morphing as a kind of real-space refinement (phenix.morph_model).
    Also, you can think of mmtbx.lockit as a simplest version of
    phenix.real_space_refine.<br>
    <br>
    Outside Phenix I would say Coot, Chimera, HermiteFit, ... there are
    many more and Google is your friend to find them.<br>
    <br>
    Just curious: why?<br>
    <br>
    Pavel<div><div class="h5"><br>
    <br>
    <div>On 7/28/14, 9:19 AM, George
      Devaniranjan wrote:<br>
    </div>
    </div></div><blockquote type="cite"><div><div class="h5">
      <div dir="ltr">Hi,
        <div><br>
        </div>
        <div>I know this is going to sound blasphemous in phenix (my
          apology particularly to Pavel) but is there other s/w that
          does similar things to <span style="color:rgb(26,26,26);font-family:Arial;font-size:9pt">phenix.real_space_refine</span><span style="color:rgb(26,26,26);font-family:Arial;font-size:9pt"> ?</span></div>
        <div><span style="color:rgb(26,26,26);font-family:Arial;font-size:9pt"><br>
          </span></div>
        <div><font color="#1a1a1a" face="Arial"><span style="font-size:9pt">I used that already (works very
              well) but was wondering if there was anything similar out
              there to do a </span><span style="font-size:12px">comparison</span><span style="font-size:9pt">.</span></font></div>
        <div><span style="color:rgb(26,26,26);font-family:Arial;font-size:9pt"><br>
          </span></div>
        <div><span style="color:rgb(26,26,26);font-family:Arial;font-size:9pt">Thank
            you,</span></div>
        <div><span style="color:rgb(26,26,26);font-family:Arial;font-size:9pt">George</span></div>
      </div>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
      </div></div><pre>_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </div>

</blockquote></div><br></div>