<div dir="ltr"><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Hi,</span><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></span></div><div><span style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">I&#39;m refining a low resolution structure of a dna-protein complex (3.7A)  &amp; wondering if someone could help me with setting restraints in Phenix to maintain the base-pair planarity of the dna?</span><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">With the restraints I have, even with a reference model, I&#39;m getting &#39;puckering&#39; of the base-pairs. Although the h-bonding distances seem to hold over time, I can&#39;t seem to find a way to keep the planarity intact.</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">Thanks in advance for your help.</div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px"><br></div><div style="font-family:arial,sans-serif;font-size:13px">-John</div></div></div>