<div dir="ltr">On Fri, Sep 26, 2014 at 8:42 AM, Phan, Jason <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jason.phan@vanderbilt.edu" target="_blank">jason.phan@vanderbilt.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word">That made me think that Phenix does model hydrogen bonding interactions, just maybe not as consistently.</div></blockquote><div><br></div><div>If this is happening it&#39;s entirely due to the way Reduce adds hydrogens - the actual minimization in phenix.refine won&#39;t do anything special.</div><div><br></div><div>-Nat</div></div></div></div>