<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML>
<HEAD><META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8"><META content="INBOX.COM" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
Hi,<div>Off topic-sorry</div><div>Is there a way to calculate RMSD&nbsp;</div><div><br></div><div>1) Considering atoms in ALT conformations?</div><div>2) considering all atoms in the protein ?</div><div><br></div><div>PYMOL seems to be throwing atoms away.</div><div><br></div><div>Thank you</div><hr size="1px" noshade style="clear:both;margin-top:10px;height:1px;">
<div style="font:12px Verdana,sans-serif;color:Black;background:white;padding:3px;line-height:1.3em">
<a href="http://mysecurelogon.com/manager"><img src="http://my.inbox.com/img/ftrs/mlman3705.jpg" width="424" height="73" alt="Can't remember your password? Do you need a strong and secure password? Use Password manager! It stores your passwords &amp; protects your account." border="0" style="margin-bottom:10px" /></a></div>
</BODY>
</HTML>