<div dir="ltr">Thanks a lot, Pavel!<br><br>Best,<br>Chen<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Sat, Oct 4, 2014 at 4:56 PM, Pavel Afonine <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:pafonine@lbl.gov" target="_blank">pafonine@lbl.gov</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Chen,<br>
    <br>
    yes:<br>
    <br>
    phenix.b_factor_statistics model.pdb<br>
    or<br>
    phenix.pdbtools model.pdb model_stat=true<br>
    <br>
    It will take case of TLS etc appropriately.<br>
    <br>
    Pavel<div><div class="h5"><br>
    <br>
    <br>
    <div>On 10/4/14 1:03 PM, Chen Zhao wrote:<br>
    </div>
    </div></div><blockquote type="cite"><div><div class="h5">
      <div dir="ltr">
        <div>
          <div>
            <div>Dear all,<br>
              <br>
            </div>
            I am just wondering whether there is a command line tool in
            phenix that calculates the average B-factor of a PDB file?
            Can it deal with the ANISOU records (from TLS refinement or
            not) properly? I looked into previous posts but the 
            --show-adp-statistics option in phenix.pdbtools seems to be
            no longer available in the version (1.9-1678) I installed.<br>
            <br>
          </div>
          Thank you so much,<br>
        </div>
        Chen<br>
      </div>
      <br>
      <fieldset></fieldset>
      <br>
      </div></div><pre>_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </div>

</blockquote></div><br></div>