<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Chen,<br>
    <br>
    yes:<br>
    <br>
    phenix.b_factor_statistics model.pdb<br>
    or<br>
    phenix.pdbtools model.pdb model_stat=true<br>
    <br>
    It will take case of TLS etc appropriately.<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 10/4/14 1:03 PM, Chen Zhao wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAADX8kBQd2s3XCjpxM5zJ0_Ke+CjjFEF8kh3MGhzVX-QBH8Y9Q@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div dir="ltr">
        <div>
          <div>
            <div>Dear all,<br>
              <br>
            </div>
            I am just wondering whether there is a command line tool in
            phenix that calculates the average B-factor of a PDB file?
            Can it deal with the ANISOU records (from TLS refinement or
            not) properly? I looked into previous posts but the�
            --show-adp-statistics option in phenix.pdbtools seems to be
            no longer available in the version (1.9-1678) I installed.<br>
            <br>
          </div>
          Thank you so much,<br>
        </div>
        Chen<br>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
</pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>