<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style id="owaParaStyle" type="text/css">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>
</head>
<body ocsi="0" fpstyle="1">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Dear colleagues,<br>
<br>
When restarting phenix followed by opening the &quot;MR-Rosetta(beta)&quot; the Settings-Directories need to be reset each time?&nbsp;
<br>
<br>
How can I set <br>
Rosetta binary directory name:&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
Rosetta binary name:&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
Rosetta script directory name: &nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
Rosetta database directory name:<br>
in Settings-Directories of &quot;MR-Rosetta(beta)&quot; wizard (or elsewhere) so that they do not change each time I restart the phenix-GUI?<br>
<br>
These settings are not changed:<br>
Base output folder:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
Rosetta path:<br>
<br>
Likely &quot;Rosetta path&quot; does not change between phenix-GUI restarts since PHENIX_ROSETTA_PATH is set in the shell as:<br>
echo $PHENIX_ROSETTA_PATH<br>
/software/apps/rosetta/2014.35/gcc01/rosetta_2014.35.57232_bundle<br>
<br>
The &quot;Path to Rosetta&quot; in &quot;Phenix preferences - Wizards&quot; is currently left blank since $PHENIX_ROSETTA_PATH is set in the shell.
<br>
<br>
I have by accident started a few jobs with mixed (new and old) settings and phenix-GUI starts without error messages and all processors are running 100% CPU, however likely in some infinite loop since no work is performed beyond &quot;place model&quot;...<br>
<div><br>
Best regards,<br>
Martin<br>
<br>
<div style="font-family: Tahoma; font-size: 13px;">
<div class="BodyFragment"><font size="2">
<div class="PlainText">Martin Moche, Ph.D.<br>
Head of Protein Crystallography<br>
Karolinska Institutet<br>
MBB/PSF<br>
Scheeles väg 2<br>
171 77 Stockholm<br>
Sweden<br>
phone:&nbsp;&nbsp; &#43;46-8-524 868 43<br>
mobile: &#43;46-73-322 93 27<br>
fax:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &#43;46-8-524 868 68<br>
email:&nbsp; Martin.Moche@ki.se<br>
</div>
</font></div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>