<div dir="ltr">Hi,<div><br></div><div>I am new to Phenix.  Sorry if my question is naive.</div><div><br></div><div>For a given mtz file, I want to pick templates from a local PDB database (its actually iTasser template library) and perform Molecular Replacement using MRage.  I have already installed Blast, downloaded iTasser PDB library (<a href="http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/library/PDB.tar.bz2">http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/library/PDB.tar.bz2</a>) and extracted sequences from both the downloaded PDB template library set and target protein for which mtz is available. </div><div><br></div><div>How should I go about building pipeline to perform MR using templates from locally downloaded select PDB database?</div><div><br></div><div>Are there any more parameters available for parameter name: services under scop: search other than &quot;local&quot; and &quot;ncbi&quot;?  <br clear="all"><div><br></div><div>Thanks in advance,</div><div>Kaushik</div>-- <br><div class="gmail_signature">People living deeply have no fear of death - Anais Nin<br>Caution: I am still the dumbest person I have ever known :-)<br></div>
</div></div>