<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>
</head>
<body bgcolor="#FFFFFF" fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Hi Pavel,
<div>Yes, mmCIF is supported in autosol/autobuild and most related utilities. &nbsp;Autosol and autobuild can also write out all results in mmCIF for compatibility with the new PDB standards.</div>
<div>All the best,</div>
<div>Tom T</div>
<div><br>
<div style="font-family: Times New Roman; color: #000000; font-size: 16px">
<hr tabindex="-1">
<div id="divRpF289795" style="direction: ltr;"><font face="Tahoma" size="2" color="#000000"><b>From:</b> phenixbb-bounces@phenix-online.org [phenixbb-bounces@phenix-online.org] on behalf of Pavel Afonine [pafonine@lbl.gov]<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, December 24, 2014 10:07 PM<br>
<b>To:</b> Rex Palmer; PHENIX user mailing list<br>
<b>Subject:</b> Re: [phenixbb] Fw: Reading a shelx file<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>Hello Rex,<br>
<br>
<blockquote type="cite">
<div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial,helvetica,sans-serif; font-size:12pt">
<div style="font-family:times new roman,new york,times,serif; font-size:12pt">
<div id="yiv1609123769">
<div>
<div style="color:#000; background-color:#fff; font-family:arial,helvetica,sans-serif; font-size:12pt">
<div><span>Can I read a Shelx file with Phenix and output the new pdb in Phenix format?</span><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</blockquote>
<br>
no, sorry. Shelx format isn't really well supported. We have some code that can parse these files but I have no idea how up-to-date it is and I doubt it is very well tested, and it is not user-level exposed.<br>
<br>
Only PDB and mmCIF are fully supported in most tools (Tom, Randy: is mmCIF supported in Phaser and Autobuil and other related utilities?).<br>
<br>
I guess you can convert Shelx file into PDB file with dedicated Shelx utility (ShelxPro?). I would expect Tim can offer more comments.<br>
<br>
Pavel<br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>