<div dir="ltr">Anna, <div>If possible try a different, perhaps more modern structure than 5PTI.</div><div>Leif</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Fri, Jan 16, 2015 at 12:33 PM, Tim Gruene <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:tg@shelx.uni-ac.gwdg.de" target="_blank">tg@shelx.uni-ac.gwdg.de</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi Anna,<br>
<br>
which version of Phenix are you using? If it is from before 2012&#39;ish,<br>
you may fix this by updating Phenix.<br>
<br>
Cheers,<br>
Tim<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5"><br>
On 01/16/2015 05:32 PM, Anna Makal wrote:<br>
&gt; Hi,<br>
&gt;<br>
&gt; I have just done a joint x-ray / neutron refinement in Phenix using 5PTI<br>
&gt; structure and data from PDB.<br>
&gt; The input contains H atoms, with positions as refined against neutron<br>
&gt; dataset.<br>
&gt;<br>
&gt; In the resulting model, all H atoms ended up in &#39;idealized X-ray&#39;<br>
&gt; positions (C-H distance of 0.96A), just as they would if I performed<br>
&gt; refinement against xray data only with riding model for H hydrogen atoms.<br>
&gt;<br>
&gt; Is it possible to run joint X-ray neutron refinement in such a manner<br>
&gt; that final H atoms positions are based on neutron data?<br>
&gt;<br>
&gt; Regards,<br>
&gt;<br>
&gt; Anna Makal<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
&gt;<br>
<br>
</div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">--<br>
Dr Tim Gruene<br>
Institut fuer anorganische Chemie<br>
Tammannstr. 4<br>
D-37077 Goettingen<br>
<br>
GPG Key ID = A46BEE1A<br>
<br>
</font></span><br>_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>