<div dir="ltr">Thank you Tim and Pavel.<div><br></div><div>Sorry, just to follow up:<div><br></div><div>For the example I gave R /Rfree difference seems high. Can this still be down to statistical fluctuations?</div><div><br></div></div><div>I am just trying to get a feel when we can simply put it down to statistical fluctuations and when its a concern.</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Jan 26, 2015 at 4:26 PM, Tim Gruene <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:tg@shelx.uni-ac.gwdg.de" target="_blank">tg@shelx.uni-ac.gwdg.de</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear George,<br>
<br>
you may also want to take into account that the variation of Rfree is<br>
estimated as Rfree^2/k, where k is the number of reflections in the<br>
shell. If you only have e.g. 100 reflections there, this might simply a<br>
statistical fluctuation, as far as I understand.<br>
<br>
Cheers,<br>
Tim<br>
<span class=""><br>
On 01/26/2015 10:05 PM, George Devaniranjan wrote:<br>
&gt; Hi,<br>
&gt;<br>
&gt; I calculated/validated several PDB structures in Phenix.Validation (GUI)<br>
&gt;<br>
&gt; The R/R-free (overall) is<br>
&gt;<br>
&gt; 0.1271/0.1348<br>
&gt;<br>
&gt; Further down I looked at the R/R-free for the highest resolution shell.<br>
&gt;<br>
&gt; Its 0.2538/0.2446<br>
&gt;<br>
</span>&gt; I am curious why the R-free for the *highest resolution shell* seems to be<br>
<span class="im HOEnZb">&gt; LOWER than R (work).<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Am I reading the information wrong?<br>
&gt;<br>
&gt; PDB: 3QL9<br>
&gt;<br>
&gt; Thank you,<br>
&gt; George<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
</span><div class="HOEnZb"><div class="h5">&gt; _______________________________________________<br>
&gt; phenixbb mailing list<br>
&gt; <a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
&gt; <a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
&gt;<br>
<br>
</div></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">--<br>
Dr Tim Gruene<br>
Institut fuer anorganische Chemie<br>
Tammannstr. 4<br>
D-37077 Goettingen<br>
<br>
GPG Key ID = A46BEE1A<br>
<br>
</font></span><br>_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>