<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">
    <link href="chrome://translator/skin/floatingPanel.css"
      type="text/css" rel="stylesheet">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Dear all, <br>
    <br>
    I am trying to refine an intermolecular disulfide bond in
    phenix.refine. The disulfide involves Cys 188 in chain A and Cys 188
    of chain B of a symmetry related molecule, with symop -X, Y+1/2,
    Z+1/2. There are two molecules in the AU, SG is P212121. I generated
    the following SSBOND entry in the pdb header:<br>
    <br>
    SSBOND 2 CYS A   188  CYS B   188                    1555  3555 2.04<br>
    <br>
    Based on this:
    <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.wwpdb.org/documentation/file-format/format33/sect6.html">http://www.wwpdb.org/documentation/file-format/format33/sect6.html</a>
    the format seems fine, but the disulfide is not being recognized
    during refinement. <br>
    <br>
    Could someone point out to me how to correctly define this for
    phenix.refine.<br>
    <br>
    Thanks!<br>
    Michael<br>
    <div style="bottom: auto; left: 662px; right: auto; top: 77px;"
      class="translator-theme-default" id="translator-floating-panel">
      <div title="Click to translate"
        id="translator-floating-panel-button"></div>
    </div>
  </body>
</html>