<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Hi everyone,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>I am working on a ~2.8 A data, Mathew coefficients suggests there are three copies of monomers (194aa) in au.&nbsp;<br>
</p>
<p>A MR solution (~12% identity with the template) was found by phenix.mr_rosetta in<span style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 16px; background-color: rgb(255, 255, 255);">&nbsp;P64 space group</span>.&nbsp;This MR solution contains two
 copies of model (only&nbsp;80aa each).&nbsp;<span style="font-size: 12pt;">But further autobuild</span><span style="font-size: 12pt;">&nbsp;cycles&nbsp;</span><span style="font-size: 12pt;">on this solution only gives R~0.48. As phenix.xtriage suggests, I add the twin law in
 the refinement, the R becomes~0.42 but still not succeed in the following autobuild cycles.&nbsp;</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">Then I trim the MR solution to poly-glycine, and do another MR search, and could find two copies of the previous MR solution. Now, the new MR solution contains four copies of search&nbsp;model (80aa each model).&nbsp;</span><span style="font-size: 12pt;">With
 the twin-law, this new MR solution</span><span style="font-size: 12pt;">&nbsp;gives R~0.37. Now I am stuck in this step. The autobuild with&nbsp;</span><span style="font-size: 12pt;">rebuild_in_place=False</span><span style="font-size: 12pt;"> or True could not further
 improve the model or R factors.</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;"><br>
</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">Any suggestions on the following model building? Or maybe the MR solution I get from phenix.mr_rosetta still not represent the correct one?</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">Thanks in advance!</span></p>
<p><span style="font-size: 12pt;">Fengyun</span></p>
</div>
</body>
</html>