<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Hi,</p>
<p><br>
</p>
<p>I'm currently using the dev 2000 version of Phenix, and noticed an issue with the automatic linking of N-linked (and presumably O-linked) glycans. If you feed a glycosylated structure
<em>sans</em>&nbsp;hydrogens to Phenix and allow ReadySet to add hydrogens prior to refinement, it adds hydrogens as if the glycans are unlinked. Then, the automatic linking script rejects them due to valence issues.</p>
<p><br>
</p>
<p>Cheers,</p>
<p><br>
</p>
<p>Tristan<br>
</p>
</div>
</body>
</html>