<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:Arial"><div>Dear All,</div><div>&nbsp;</div><div>By Phenix.real_space_refine if is very nic to fit a PDB into an EM map, and we can get a fitted PDB. However no matter what is the run strategy (default, morphing, local grid search, etc), in the got PDB the B-factors for each atom in the coordinates were always those from the original input PDB, which may make the B-factors in refined PDB meaningless. As finally we need to deposit the refined PDB and EM to the database, will you please explain how to settle the B-factor issues in the refined PDB related to Phenix.real_space_refine?</div><div>&nbsp;</div><div>Smith</div><div>&nbsp;</div></div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>