<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Alexandra,<br>
    <br>
    to get anomalous difference map you do not need to do anything
    special: phenix.refine calculates this map by default as long as
    your input data are Fobs(+) and Fobs(-) or Iobs(+) and Iobs(-).<br>
    <br>
    Refining occupancy of Mo may not be a bad idea given it is likely to
    be partially occupied.<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 6/17/15 06:04, Alexandra Marques
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
cite="mid:CAN_Pk51y3+a3A7E7JwEkZT6Xm5ZPPo-OnD+J1NU8wxxe-Xhdeg@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div dir="ltr">
        <p class="MsoNormal">Hi,</p>
        <p class="MsoNormal"><br>
        </p>
        <p class="MsoNormal">I am in the last refinement steps of a MR
          model and I want
          to calculate an anomalous difference map<span style="">
          </span>essentially to confirm the presence of a sulfite
          molecule and to locate vanadium
          (present in soaking solution). I read that it is necessary to
          have a mtz file
          with anomalous data (i.e. F+,F- or I+,I-). However, my data
          was collected at “normal”
          wavelenght (0.97) and it was processed with XDS considering
          Friedls law= true
          and my mtz file contain the following columns: H K L FP SIGFP.
          So, can I still
          calculate a anomalous difference map based on my data?</p>
        <p class="MsoNormal"><br>
        </p>
        <p class="MsoNormal">Since I also have a Mo atom in the active
          site can I try to
          refine its occupancy by using the option “anomalous groups” in
          the refinement
          strategy? <br>
        </p>
        <p class="MsoNormal"><br>
        </p>
        <p class="MsoNormal">Thank you very much, </p>
        <span
style="font-size:11pt;line-height:115%;font-family:&quot;Calibri&quot;,&quot;sans-serif&quot;">Alexandra</span></div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
Unsubscribe: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>