<div style="line-height:1.7;color:#000000;font-size:14px;font-family:Arial"><div>Dear All,</div><div><br></div><div>Is any method to make the density modified map (from AutoBuild) comparable to the&nbsp; 2mFo-DFc map (from phenix.refine)?</div><div><br></div><div>Smith<br><br><br><br><br><br></div><div style="position: relative; -ms-zoom: 1;"></div><div id="divNeteaseMailCard"></div><div><br></div><pre><br>
-------- Forwarding messages --------
From: "Pavel Afonine" &lt;pafonine@lbl.gov&gt;
Date: 2015-06-19 00:16:45
To:  phenixbb@phenix-online.org
Subject: Re: [phenixbb] Autobuild Density
Hi Appu,

a guess: perhaps you are comparing density modified map (from AutoBuild) 
with 2mFo-DFc map (from phenix.refine). If that's the case the maps are 
going to look differently indeed, so it's not too unexpected.

Pavel

On 6/18/15 08:47, Appu kumar wrote:
&gt; Dear All,
&gt; I have query about the density map from autobuild. The density map 
&gt; from the autobuild look exceptionally good at 3.8A resolution. But 
&gt; when i refined the autobuild pdb against the original mtz file, the 
&gt; density become worse. Is it i am doing something wrong or i have to 
&gt; use some parameterization? Structure is solved with the MR.
&gt; Appu

_______________________________________________
phenixbb mailing list
phenixbb@phenix-online.org
http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb
Unsubscribe: phenixbb-leave@phenix-online.org
</pre></div><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>