<div dir="ltr"><div>Greetings</div><div> I am trying to place a ligand (CIT) in </div><div>a protein model that already have some citrate ligands placed. I am doing this using Coot&#39;s option &quot;get monomer&quot;, and after the fitting of ligand in the density I tried to refine the model using the ligand and the protein pdb as input models. Refinement did not start and I got an error message in Phenix- &quot;Number of groups of duplicate atom labels:.....&quot;</div><div>Could someone please explain how could I get past this error message and what is the correct way to add a ligand to a model that already has some of the ligands</div><div>of the same type.</div><div><br></div><div>Many thanks in advance</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Manoj Saxena</div><div><br></div><div><br></div></div>