<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    Hi Reza,<br>
    <br>
    you can have as many as you can fit into memory of your computer.<br>
    <br>
    Note, you need to provide the whole molecule as the input (not one
    copy plus MTRIX/BIOMT matrices). If you only have one copy plus
    MTRIX/BIOMT matrices you can use phenix.pdb.mtrix_reconstruction or
    phenix.pdb.biomt_reconstruction tools to obtain the whole model (the
    GUI equivalents of these command line tools are available, I think).<br>
    <br>
    Running real-space refinement (phenix.real_space_refine) would be
    less memory intensive than reciprocal space refinement
    (phenix.refine). You did not mention what data you have, X-ray or
    Cryo-EM, so I would not tell much about this.<br>
    <br>
    Anyway, you should be able to do what you want without problems. If
    you have any questions or problems or need any help please let me
    know!<br>
    <br>
    Good luck!<br>
    Pavel<br>
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 10/1/15 17:10, Reza Khayat wrote:<br>
    </div>
    <blockquote cite="mid:1443744655581.53744@ccny.cuny.edu" type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <style type="text/css" style="display:none"><!--P{margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
      <p>Hi,</p>
      <p><br>
      </p>
      <p>I need to use icosahedral symmetry to refine a virus crystal
        structure. Does phenix support 60 NCS matrices? If not, how
        should I go about recompiling the program so that I can have 60
        NCS matrices?
      </p>
      <p><br>
      </p>
      <p>Best wishes,<br>
        Reza<br>
      </p>
      <p><br>
      </p>
      <div id="Signature">
        <div name="divtagdefaultwrapper"
          style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;
          font-size:; margin:0">
          Reza Khayat, PhD
          <div>Assistant Professor�</div>
          <div>City College of New York</div>
          <div>Department of Chemistry</div>
          <div>New York, NY 10031</div>
        </div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
Unsubscribe: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>