<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Hi Scott,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>&quot;<span style="color: rgb(33, 33, 33); font-family: 'Segoe UI', 'Segoe WP', 'Segoe UI WPC', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 15px; background-color: rgb(255, 255, 255);">I am currently assuming that the histogram matching does not use model building
 as part of it, and would like to know if this interpretation is correct.</span>&#8203;&quot;<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Yes, that is correct. The histogram matching part of resolve density modification&nbsp;does not require model-building. &nbsp;However if you use build=true then some density modification steps will indeed use the model-based information as part of the density modification
 target.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>All the best,<br>
</p>
<p>Tom T<br>
</p>
<p><br>
</p>
<div style="color: rgb(33, 33, 33);">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> phenixbb-bounces@phenix-online.org &lt;phenixbb-bounces@phenix-online.org&gt; on behalf of Scott Horowitz &lt;horowsah@umich.edu&gt;<br>
<b>Sent:</b> Thursday, December 10, 2015 8:51 AM<br>
<b>To:</b> PHENIX user mailing list<br>
<b>Subject:</b> [phenixbb] autosolve density modification question</font>
<div>&nbsp;</div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">Hi, a quick question: if when running autosolve on SAD data, if I set the parameter build = false, will that disable all model building, including any model building that would be a part of the density modification process? I'm especially curious
 about &nbsp;the case if build = false, but mask_type = histograms. I am currently assuming that the histogram matching does not use model building as part of it, and would like to know if this interpretation is correct.
<div>
<div><br>
</div>
<div>Thanks,</div>
<div>Scott</div>
<div><br>
</div>
-- <br>
<div class="gmail_signature">
<div dir="ltr"><span><font color="#888888">
<div dir="ltr">
<div style="font-family:Helvetica; word-wrap:break-word"><font>Scott Horowitz, Ph.D.<br>
</font></div>
<div style="font-family:Helvetica; word-wrap:break-word"><font>Research Associate</font></div>
<div style="font-family:Helvetica; word-wrap:break-word"><font>Howard Hughes Medical Institute</font></div>
<div style="font-family:Helvetica; word-wrap:break-word"><font><br>
University of Michigan<br>
Department of Molecular, Cellular, and&nbsp;Developmental Biology<br>
Bardwell lab<br>
830 N. University Ave, Room 4007<br>
Ann Arbor, MI 48109<br>
phone:&nbsp;<a value="&#43;17346476683" style="color:rgb(17,85,204)">734-647-6683</a><br>
fax:&nbsp;<a value="&#43;17346154226" style="color:rgb(17,85,204)">734-615-4226</a></font></div>
</div>
</font></span></div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>