<div dir="ltr">Dear Phenixbb members,<div><br></div><div><div>I am using Phaser MR for solving a homodimer DNA binding protein with dsDNA complex structure. I&#39;d like to use sequence file rather then molecular weight in the component definition of ASU.  As there are solved homodimer protein structures (amino acid identity 100%) on PDB, I can download seq file (fasta form) from PDB webpage, but the seq file is only for one protein chain.  I also tried online tools like &quot;make sequence from PDB file&quot; (<a href="http://swift.cmbi.ru.nl/servers/html/soupir.html">http://swift.cmbi.ru.nl/servers/html/soupir.html</a>), when I put the protein dimer bound to dsDNA pdb into the online tool, the outtput pir sequence file only shows a single protein chain and dna which dose not seems like two strands, rather then just put two 23base dna together for a 46 base length single strand DNA.</div><div><br></div><div>I am asking is there a way to generate sequence file for a homodimer and dsDNA? or I have to generate sequence file for each chain separately (there will be four sequence files in this case, two protein chains and two dna chains)? </div><div><div><br></div><div>Thanks.</div><div><br></div><div>Alex</div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div>Alex</div></div></div></div>