<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    <br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 02/21/2016 11:33 PM, Georg Mlynek
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote cite="mid:56CA3B4C.2090009@univie.ac.at" type="cite">
      <meta content="text/html; charset=windows-1252"
        http-equiv="Content-Type">
      Dear scientific community,<br>
      <br>
      1. <br>
      <br>
      if I put in the gui under Modify selections for: Occupancies /
      simple occupancy refinement<br>
      <br>
      resname SO4 <br>
      resname GOL<br>
      <br>
      <br>
      <br>
      phenix outputs different occupancies for each of the elements in
      the molecule.<br>
      <br>
      <img src="cid:part1.09000903.01000908@univie.ac.at" alt=""><br>
      <br>
      Is the atom selection syntax wrong or is it a bug?� (Ready set is
      also not flagging or correcting this, would be nice is this can be
      implemented)<br>
      <br>
      2. I used phenix optimize final model and I wonder why it refines
      K anisotropic but not NA and CL. <br>
      (I would be very nice, if the program could summarize at the end
      which settings and strategies were finally used, so this can be
      added to the publication: I know it is under development)<br>
      �<br>
      <br>
      �adp {<br>
      ����� individual {<br>
      ������� isotropic = not (element K)<br>
      ������� anisotropic = (element K)<br>
      ����� }<br>
      <br>
      � }<br>
      ��� occupancies {<br>
      ����� individual = resname NA or resname K or resname CL<br>
      ����� remove_selection = None<br>
      ����� constrained_group {<br>
      ������� selection = None<br>
      ����� }<br>
      <br>
      <br>
      I am using ubuntu 15.10<br>
      <br>
      phenix version dev-2313-000<br>
      <br>
      Many thanks in advance, best regards Georg.<br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>