<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!--P{margin-top:0;margin-bottom:0;} p
        {margin-top:0;
        margin-bottom:0}--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p><font size="2"><span style="font-size:10pt;">Dear PHENIX Developers,</span></font></p>
<p><font size="2"><span style="font-size:10pt;">I would like to perform phenix.refine using amber gradient. I installed AmberTools 15 and the newest version of Phenix by following the instruction found here
</span></font></p>
<p><font size="2"><span style="font-size:10pt;"><a href="http://www.phenix-online.org/documentation/reference/amber.html">http://www.phenix-online.org/documentation/reference/amber.html.</a></span></font></p>
<p><font size="2"><span style="font-size:10pt;">However, when I ran&quot;phenix.AmberPrep&quot;, it complains &quot;phenix.AmberPrep not found&quot;. In dead, I cannot find&nbsp;any binary named &quot;phenix.AmberPrep&quot;. However, it looks to me that phenix is installed OK and so does AmberTools
 15. I checked each step of my installation, I could not find anywhere is wrong. Can you please help me out? Thank you!</span></font></p>
<p><br>
<font size="2"><span style="font-size:10pt;"></span></font></p>
<p><font size="2"><span style="font-size:10pt;">Sincerely,<br>
Jing-Yuan</span></font><br>
</p>
</body>
</html>