<div dir="ltr"><div><div><div><div><div>Dear Colin,<br><br><br></div>I agree with everything Tim and Kay said above. i5 or i7 of the same frequency and core count will perform similarly with Xeons (even across all generations of intel core/xeon processors). Adding more cores will help the refining process (under linux and mac only), but unless the computer is being used simultaneously by multiple users, I do not see the cost-effectiveness in running a 36-core/72-thread dual Xeon E5. <br><br></div>As to the OS choice, another interesting point regarding cost arises. Top performance Mac you can buy as of April 2016 is a 12-core 2.7Ghz Xeon (a 3-year old processor), setting you back a whooping 9000 USD. With the help of a tech-savvy student or postdoc, you can easily build something that runs circles around that mac pro with 1/3 of the cost. However you will have to live with Linux, which is not half bad if you get used to it.<br><br></div>I personally still prefer OSX and I run an old dell optiplex with a quad-core i5 (apple won&#39;t be happy but it is their fault for not updating their product). It only took me half a day to put OSX and all crystallization software I need on it and everything run like a dream. Due to the lack of performance and high price of Mac Pros, if you want a fast Mac, building a hackintosh is your only choice as of today.<br><br></div>Hope it helps.<br><br></div>Changrui<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Apr 13, 2016 at 3:57 AM, Kay Diederichs <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:kay.diederichs@uni-konstanz.de" target="_blank">kay.diederichs@uni-konstanz.de</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Colin,<br>
<br>
check out the first option in the FAQ at<br>
<a href="https://www.phenix-online.org/documentation/faqs/refine.html" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.phenix-online.org/documentation/faqs/refine.html</a><br>
<br>
A core i7 and a Xeon of the same generation are equally fast if their<br>
frequency is the same. The main differences are that<br>
- Xeon E3 supports ECC memory (most core i* don&#39;t)<br>
- Xeon E5 supports Dual-CPU (core i* is just one)<br>
- Xeon E7 supports multi-CPU and is very expensive<br>
- most Xeons don&#39;t have built-in graphics whereas most core i* do<br>
There are many other small differences but most of them irrelevant;<br>
inspect the Wikipedia pages!<br>
<br>
Xeons won&#39;t be faster with phenix.refine; a core i7 already has enough<br>
cores - to increase their usage you&#39;ll have to recompile as per the FAQ.<br>
<br>
HTH,<br>
<br>
Kay<br>
<br>
&gt;<br>
&gt; Message: 1<br>
&gt; Date: Mon, 11 Apr 2016 07:56:39 +0000<br>
&gt; From: Colin Levy &lt;<a href="mailto:C.Levy@manchester.ac.uk">C.Levy@manchester.ac.uk</a>&gt;<br>
&gt; To: &quot;<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>&quot; &lt;<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>&gt;<br>
&gt; Subject: [phenixbb] Hardward phenix.refine<br>
&gt; Message-ID: &lt;<a href="mailto:773C4580-FA01-4246-86E9-2D73AFD98421@manchester.ac.uk">773C4580-FA01-4246-86E9-2D73AFD98421@manchester.ac.uk</a>&gt;<br>
&gt; Content-Type: text/plain; charset=&quot;us-ascii&quot;<br>
<div class="HOEnZb"><div class="h5">&gt;<br>
&gt; Dear all,<br>
&gt;<br>
&gt; Having read the FAQ regarding hardware I have a few ideas but would greatly appreciate any input from the community or developers.<br>
&gt;<br>
&gt; Would anyone like to suggest the best configuration of hardware for running phenix.refine? I mainly operate in OSX but have no issue with switching operating system if I can get a faster setup.  My current thoughts are either something running a 4GHz Quad core i7 or an alternative would be a 3.7GHz Quad-Core Intel Xeon E5 (iMac v Mac Pro) or equivalent Linux builds.<br>
&gt;<br>
&gt; I know that the i7 is reasonably fast as I have this setup in a different machine and phenix.refine runs reasonably quickly but as ever I would like it to be faster. Budget is not unlimited by any means but I would be interested in learning what an optimal setup might look like.<br>
&gt;<br>
&gt; Many thanks,<br>
&gt;<br>
&gt; Colin<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Manchester<br>
&gt; Protein<br>
&gt; Structure<br>
&gt; Facility<br>
&gt;<br>
&gt; Dr. Colin W. Levy<br>
&gt; MIB G034<br>
&gt; Tel.  0161 275 5090<br>
&gt; Mob.07786 197 554<br>
&gt; <a href="mailto:c.levy@manchester.ac.uk">c.levy@manchester.ac.uk</a>&lt;mailto:<a href="mailto:c.levy@manchester.ac.uk">c.levy@manchester.ac.uk</a>&gt;<br>
&gt;<br>
&gt;  Manchester Institute of Biotechnology | University of Manchester | 3.020 Garside Building | 131 Princess Street | Manchester | M1 7DN<br>
<br>
</div></div><br>_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org">phenixbb-leave@phenix-online.org</a><br></blockquote></div><br></div>