<div dir="ltr">Dear Phenixbb members,<div><br></div><div>I have a protein (90aa length) structure with 2.3A resolution and space group P21 refined to Rfree/R to around 0.27 / 0.20. There are 3 protein dimers in one asym unit. For two dimers (chain A, B, C, D), I can see clearly continuous electron density from residue 10 to residue 89. However for the third dimer (chain E and F), I can only see clearly continuous density between residue 10 to residue 72 and lost tracing of the main chain.  I did see a large electron density blob close to the third dimer. (<span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Roboto,RobotoDraft,Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:13px;line-height:20px"><a href="https://goo.gl/photos/R1SaHPKS6VLfcesb7">https://goo.gl/photos/R1SaHPKS6VLfcesb7</a> ; G</span><span style="font-size:13px;color:rgb(33,33,33);font-family:Roboto,RobotoDraft,Helvetica,Arial,sans-serif;line-height:20px">reen is positive density at 3 sigma and blue is FWT PHWT at 2sigma and 1sigma </span><font color="#212121" face="Roboto, RobotoDraft, Helvetica, Arial, sans-serif"><span style="line-height:20px">). I do not know how to explain this blob. It seems to me that this blob is unlikely protein fragments (some parts of the blob is so chunky). Even if it&#39;s true that it&#39;s certain protein fragment between residue 73 to residue 89 of chain E or chain F, then the position of this fragment is totally different from the position of its fragment counterparts in chain A,B, C,D. I assume NCS copies (in this case maybe 3 copies) should have the same morphology as to each other.  </span></font></div><div><br></div><div>It also seems to me that this density is not from my crystal growth or harvest conditions, which has: Bis-Tris; PEG3350; PEG400 and NaCl. </div><div><br></div><div>I do not know if Phenix Autobuild could build this automatically for me, but I&#39;ll try this later.</div><div><br></div><div>Thanks in advance for any input on this.</div><div><br></div><div>The density link is: <span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Roboto,RobotoDraft,Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:13px;line-height:20px"><a href="https://goo.gl/photos/R1SaHPKS6VLfcesb7">https://goo.gl/photos/R1SaHPKS6VLfcesb7</a></span></div><div><span style="color:rgb(33,33,33);font-family:Roboto,RobotoDraft,Helvetica,Arial,sans-serif;font-size:13px;line-height:20px"><br></span></div></div>