<div dir="ltr">Hi Nick,<div>something like this should work - this case for instance a Thr in two conformations and a water off of the OG1 from one conformation.</div><div><br></div><div>Cheers,</div><div>Jan</div><div><br></div><div>







<p class=""><font face="monospace, monospace"><span class="">refinement </span><span class="">{</span></font></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">  refine {</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">    occupancies {</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">      constrained_group {</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">        selection = chain A and resseq 256 and altloc A or \</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">                    chain S and resseq 114 </font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">        selection = chain A and resseq 256 and altloc B </font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">   }</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">  }</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace"> }</font></span></p>
<p class=""><span class=""><font face="monospace, monospace">}</font></span></p></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 11, 2016 at 9:41 PM, Schnicker, Nicholas J <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:nicholas-schnicker@uiowa.edu" target="_blank">nicholas-schnicker@uiowa.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Dear all,</p>
<p><br>
</p>
<p>I am trying to do use constrained groups with occupancy refinement but struggling with syntax. I am trying to define selection1 as 2 different atoms and selection2 as another 2 different atoms. Therefore I want the 2 atoms in selection1 to have the same
 occupancy and the atoms in selection2 to have the same and the sum of selection 1 and 2 will be 1. If someone could help me with this syntax I would appreciate it! I have tried using brackets to separate selections but phenix doesn&#39;t recognize this.</p>
<p><br>
</p>
<p>I can provide more information if needed, it&#39;s just a complicated scenario.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Thanks!</p>
<p>Nick<br>
</p>
</div>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org">phenixbb-leave@phenix-online.org</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature">Jan Abendroth<br>Emerald Biostructures<br>Seattle / Bainbridge Island, WA, USA<br>home: <a href="http://Jan.Abendroth_at_gmail.com" target="_blank">Jan.Abendroth_at_gmail.com</a><br>work: JAbendroth_at_embios.com<br><a href="http://www.emeraldbiostructures.com" target="_blank">http://www.emeraldbiostructures.com</a><br></div>
</div>