
<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style>

</head>

<body fpstyle="1" ocsi="0">

<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Dear all,

<div><br>

</div>

<div>I am refining a structure after renumbering my chain such that there is a gap in numbering (i.e. chain A ends at 350 and then starts again at 1000) as this has numbering has been recommended for us to use by the PDB for our fusion proteins. I'm having

 issues with Phenix.refine not understanding that their is still a peptide bond and breaks the chain and pushes the atoms away. There is no TER card between the chains and I've used LINK records as well to no avail. I'm wondering how to properly deal with this.</div>

<div><br>

</div>

<div>Thanks,</div>

<div>Jason</div>

</div>

</body>

</html>