<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none"><!-- p { margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; }--></style>
</head>
<body dir="ltr" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">
<p>Hi Reza,<br>
</p>
<p>In the simplest case, you can use the reflections editor in the GUI and select phases from one dataset and amplitudes from another. If you want to combine HL coefficients you can use a script to do it (see&nbsp;<a href="https://solve.lanl.gov/Resolve/html_resolve_manual/resolve_sample_scripts.htm#merge_phases">https://solve.lanl.gov/Resolve/html_resolve_manual/resolve_sample_scripts.htm#merge_phases</a>&#8203;
 ).<br>
</p>
<p>All the best,<br>
</p>
<p>Tom T<br>
</p>
<div dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Reza Khayat &lt;rkhayat@ccny.cuny.edu&gt;<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, August 24, 2016 6:28 AM<br>
<b>To:</b> Terwilliger, Thomas Charles; phenixbb@phenix-online.org<br>
<b>Subject:</b> Re: Combining amplitudes and phases</font>
<div>&nbsp;</div>
</div>
<div>
<p>Hi Tom,<br>
</p>
<p><br>
Thanks for the prompt response. This is what I'm trying to do. I'm having difficulty figuring out what Phenix programs to use for doing this.&nbsp;</p>
<p><br>
</p>
<p>Best wishes,<br>
Reza</p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
&#8203;</div>
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
Reza Khayat, PhD
<div>Assistant Professor&nbsp;</div>
<div>City College of New York</div>
<div>Department of Chemistry</div>
<div>New York, NY 10031</div>
</div>
</div>
<div dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> Terwilliger, Thomas Charles &lt;terwilliger@lanl.gov&gt;<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, August 24, 2016 8:23 AM<br>
<b>To:</b> Reza Khayat; phenixbb@phenix-online.org<br>
<b>Cc:</b> Terwilliger, Thomas Charles<br>
<b>Subject:</b> Re: Combining amplitudes and phases</font>
<div>&nbsp;</div>
</div>
<div>
<p>&#8203;Hi Reza,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Yes, if two crystals of your molecules&nbsp;are isomorphous then it is reasonable to guess that both the phases and the amplitudes for the two crystals are similar. &nbsp;In such a&nbsp;case, as a first approximation to the structure factors for either crystal, you could
 take the amplitudes from one and the phases for the other. You could also average phases or amplitudes from the two crystals. &nbsp;In all&nbsp;these cases you would want to be aware that you are using information from different crystals at this stage in structure determination
 and therefore that the maps that you would get would have mixed information about the two crystals.</p>
<p><br>
</p>
<p>All the best,</p>
<p>Tom T</p>
<p>&nbsp;<br>
</p>
<div dir="ltr" style="font-size:12pt; color:#000000; background-color:#FFFFFF; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<hr tabindex="-1" style="display:inline-block; width:98%">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" color="#000000" style="font-size:11pt"><b>From:</b> phenixbb-bounces@phenix-online.org &lt;phenixbb-bounces@phenix-online.org&gt; on behalf of Reza Khayat &lt;rkhayat@ccny.cuny.edu&gt;<br>
<b>Sent:</b> Wednesday, August 24, 2016 5:48 AM<br>
<b>To:</b> phenixbb@phenix-online.org<br>
<b>Subject:</b> [phenixbb] Combining amplitudes and phases</font>
<div>&nbsp;</div>
</div>
<div>
<p>Hi,<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Is it possible to combine amplitudes from one dataset with phases from another?&nbsp;Assume that the systems are isomorphous. Thanks.<br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Best wishes,<br>
Reza<br>
</p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div name="divtagdefaultwrapper" style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; font-size:; margin:0">
Reza Khayat, PhD
<div>Assistant Professor&nbsp;</div>
<div>City College of New York</div>
<div>Department of Chemistry</div>
<div>New York, NY 10031</div>
</div>
</div>
<p><br>
</p>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>