<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=windows-1252"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <p>Dear Henry, you can find the answer here</p>
    <p><a class="moz-txt-link-freetext" href="https://www.phenix-online.org/newsletter/CCN_2015_07.pdf#page=12">https://www.phenix-online.org/newsletter/CCN_2015_07.pdf#page=12</a></p>
    <p>example 5. Unfortunately 1EJG does not open in coot, because of a
      coordinate read error <br>
    </p>
    <p>ERROR 42 READ: Duplicate sequence number and insertion code.<br>
      †††††††† LINE #875<br>
      †††† ATOM††† 414† CA BSER A† 22†††††† 6.034† 13.399† -2.687† 0.21†
      1.55 <br>
    </p>
    <p>However pymol works.<br>
    </p>
    <p>The example is crambin<br>
    </p>
    <p><img src="cid:part1.2E929F35.3BE23F55@univie.ac.at" alt=""></p>
    <p><br>
      Here is pasted and changed a bit one sentence from the newsletter:<br>
    </p>
    <p>If residuenumber and chain ids are identical,while altloc are
      different, as well as residue names are allowed to be different.</p>
    <p>So you have to remove <br>
    </p>
    <pre><font size="2">27             AChar           iCode         Code for insertion of residues.
</font></pre>
    <p>this should work</p>
    <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">ATOM†† 6500† CA
        ACYS B 101<o:p></o:p></span></p>
    <span style="font-size:11.0pt">ATOM†† 6490† CA BXXX B 101<br>
      <br>
      Phenix will handle this then automatically.<br>
      <br>
      Best regards, Georg.<br>
      <br>
      <br>
      <br>
      <br>
    </span>
    <div class="moz-cite-prefix">On 10/15/2016 11:15 PM, van den Bedem,
      Henry wrote:<br>
    </div>
    <blockquote
      cite="mid:4DAB33E8-6A82-46BD-8C50-A33CE59E3A7F@slac.stanford.edu"
      type="cite">
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html;
        charset=windows-1252">
      <meta name="Title" content="">
      <meta name="Keywords" content="">
      <meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered
        medium)">
      <style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:"Cambria Math";
        panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0in;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:Calibri;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
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a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
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        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:Calibri;
        color:windowtext;}
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        {mso-style-type:export-only;
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        font-family:Calibri;}
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div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style>
      <div class="WordSection1">
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Hi:<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p>†</o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Iím refining
            a site where thereís two compounds, each at partial
            occupancy. I modeled that using alt codes and insertion
            codes combined, like this<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p>†</o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">ATOM†† 6500†
            CA ACYS B 101B<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">ATOM†† 6490†
            CA BXXX B 101A<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p>†</o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">How can I
            constrain the occupancies so that they sum to unity? I tried
            several option, but the distinct insertions seem to refine
            independently. Sorry if a similar question has been posted
            before, but I could not find a solution searching phenixbb.<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p>†</o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Thanks!<o:p></o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><o:p>†</o:p></span></p>
        <p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Henry<o:p></o:p></span></p>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <br>
      <pre wrap="">_______________________________________________
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    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>