<div dir="ltr">Oliver<div><br></div><div>My Rosetta 3.7 is 2016.32. Not sure why we are different.</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr">Cheers<div><br></div><div>Nigel<div><br></div><div>---</div><div>Nigel W. Moriarty<br>Building 33R0349, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging</div><div>Lawrence Berkeley National Laboratory<br>Berkeley, CA 94720-8235<br>Phone : 510-486-5709     Email : NWMoriarty@LBL.gov<br>Fax   : 510-486-5909       Web  : <a href="http://CCI.LBL.gov" target="_blank">CCI.LBL.gov</a></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Mar 21, 2017 at 8:19 AM, Oliver Clarke <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:olibclarke@gmail.com" target="_blank">olibclarke@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div style="word-wrap:break-word">Hi Nigel,<div><br></div><div>I tried with rosetta 3.7 (2016.46) and phenix dev-2719, and this time compilation using rosetta.build_phenix_interface was successful (scons finished building targets with no errors), but when I run rosetta.run_tests it still crashes, though with a different error (see attached log). Any ideas as to how to fix?</div><div><br></div><div>Cheers</div><div>Oli</div><div><br></div><div></div></div><br><div style="word-wrap:break-word"><div><br><div><div><blockquote type="cite"><div>On Mar 20, 2017, at 7:31 PM, Nigel Moriarty &lt;<a href="mailto:nwmoriarty@lbl.gov" target="_blank">nwmoriarty@lbl.gov</a>&gt; wrote:</div><br class="m_-465407669536563538Apple-interchange-newline"><div><div dir="ltr">Oliver<div><br></div><div>We are currently only supporting up to Rosetta 3.7 as a c++11 compiler is required for any subsequent versions. We have compiled using a c++11 compiler with no problems so I suggest you revert to 3.7 or check the logs for compilation problems.</div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="m_-465407669536563538gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr">Cheers<div><br></div><div>Nigel<div><br></div><div>---</div><div>Nigel W. Moriarty<br>Building 33R0349, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging</div><div>Lawrence Berkeley National Laboratory<br>Berkeley, CA 94720-8235<br>Phone : <a href="tel:(510)%20486-5709" value="+15104865709" target="_blank">510-486-5709</a>     Email : <a href="mailto:NWMoriarty@LBL.gov" target="_blank">NWMoriarty@LBL.gov</a><br>Fax   : <a href="tel:(510)%20486-5909" value="+15104865909" target="_blank">510-486-5909</a>       Web  : <a href="http://cci.lbl.gov/" target="_blank">CCI.LBL.gov</a></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Mon, Mar 20, 2017 at 9:34 AM, Oliver Clarke <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:olibclarke@gmail.com" target="_blank">olibclarke@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
Phenix rosetta refinement worked with previous versions of rosetta and phenix, but with the latest Rosetta version (3.8) and latest phenix nightly I get a crash when running rosetta.run_tests after building the rosetta phenix interface, which runs a test run of phenix.rosetta_refine. It gets to the stage of generating initial models and then crashes - see attached log. Ideas for a fix welcome!<br>
<br>
Cheers<br>
Oli<br>
<br>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailm<wbr>an/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb-leave@phenix-online.o<wbr>rg</a><br></blockquote></div><br></div>
</div></blockquote></div><br></div></div></div><br></blockquote></div><br></div>