<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;" dir="ltr">
<p>Dear all,</p>
<p><br>
</p>
<p>If I want to calculate&nbsp;FSC curve&nbsp;between experimental cryo EM map and model, what is the correct procedure to do so?</p>
<p><br>
</p>
<p>I will explain what I have tried so far. Although I have variable local resolution in my map, according to FSC=0.143 criterion I have a 4 Ang map (say 1.mrc),&nbsp;I have used 'molmap' command in Chimera to generate a simulated map at 4&nbsp;Ang. Then I used&nbsp;&quot;vop
 resample&quot; to take care of the pixel and box values&nbsp;( then&nbsp;saved as&nbsp;2.mrc). Thereafter, I have used &quot;<span>e2proc3d.py 1.mrc fsc.txt --calcfsc=2.mrc and plotted the fsc.txt file to get the curve.&nbsp;</span></p>
<p><span><br>
</span></p>
<p><span>I am not sure if I am on the right track. My pixel size is 1.28.</span></p>
<p><br>
</p>
<div id="Signature">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt; font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif; background-color:rgb(255,255,255)">
<p style="color:rgb(0,0,0)">Best regards,</p>
<p style="color:rgb(0,0,0)">Tofayel</p>
<p class="MsoNormal" style="color:rgb(0,0,0)"></p>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>
<p style="color:rgb(0,0,0)"></p>
<p style="color:rgb(0,0,0)"></p>
<p style="color:rgb(0,0,0)"><span style="font-size:12pt"></span></p>
</div>
</div>
</div>
</body>
</html>