<div style="color:rgb(49,49,49);font-size:1rem;word-spacing:1px" dir="auto"><div style="font-size:1rem"><div style="font-size:1rem">Hi all<br><br>I have some trouble installing rosetta. I followed the instruction as in <a href="https://www.phenix-online.org/documentation/reference/rosetta_install.html" target="_blank" style="font-size:1rem">https://www.phenix-online.org/documentation/reference/rosetta_install.html</a><br><br>and everything went ok up to<br><br>% rosetta.build_phenix_interface nproc=n<br><br>but then<br><br>% rosetta.run_tests<br><br>fails with <br><br>Rosetta command-line arguments:<br>  -parser:protocol /buffer/desancti/xtal/rosetta_src_2016.32.58837_bundle/main/source/src/apps/public/crystal_refinement/low_resolution_refine.xml<br>  -s 1yjp_rosetta_in.pdb<br>  -mtzfile 1yjp_rosetta_data.mtz<br>  -run:preserve_header<br>  -crystal_refine<br>  -parser:script_vars symmdef=1yjp_rosetta.symm<br>  -parser:script_vars bfactstrat=individual<br>  -parser:script_vars map_type=Auto<br>  -score:weights talaris2013_cart<br>  -nstruct 1<br><br>Generating 2 models on 1 processors...<br><br>DEBUG dumping error message<br>ERROR: Rosetta exited with status 139<br>stderr output:<br>Segmentation fault (core dumped)<br>Traceback (most recent call last):<br>  File &quot;/buffer/desancti/xtal/phenix/phenix-1.12-2829/build/../modules/phenix/phenix/command_line/rosetta_refine.py&quot;, line 305, in &lt;module&gt;<br>    run(sys.argv[1:], create_dir=True)<br>  File &quot;/buffer/desancti/xtal/phenix/phenix-1.12-2829/build/../modules/phenix/phenix/command_line/rosetta_refine.py&quot;, line 191, in run<br>    debug=params.output.debug)<br>  File &quot;/buffer/desancti/xtal/phenix/phenix-1.12-2829/modules/phenix/phenix/rosetta/refine.py&quot;, line 313, in __init__<br>    self.run_jobs()<br>  File &quot;/buffer/desancti/xtal/phenix/phenix-1.12-2829/modules/phenix/phenix/rosetta/refine.py&quot;, line 388, in run_jobs<br>    check_result(result)<br>  File &quot;/buffer/desancti/xtal/phenix/phenix-1.12-2829/modules/phenix/phenix/rosetta/refine.py&quot;, line 379, in check_result<br>    raise RuntimeError(&quot;Aborted due to error in job %d.&quot; % result.job_id)<br>RuntimeError: Aborted due to error in job 1.<br><br><br></div>Any idea?<br><br></div>thanks<br><br></div><span style="color:rgb(49,49,49);word-spacing:1px;background-color:rgb(255,255,255)">Daniele</span><br style="color:rgb(49,49,49);word-spacing:1px"><div style="color:rgb(49,49,49);word-spacing:1px" dir="auto"><div style="font-size:1rem" dir="auto"><br></div></div>