
<html dir="ltr">

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-8-i">

<style type="text/css" id="owaParaStyle">P {margin-top:0;margin-bottom:0;}</style>

</head>

<body fpstyle="1" ocsi="0">

<div style="direction: ltr;font-family: Arial;color: #0000FF;font-size: 10pt;">Hi,<br>

<br>

I noticed a small change in output pdb between these two versions in the molprobity report&nbsp; (these are two different runs, so ignore the numerical values)t:<br>

<br>

<div><u>dev-2919:</u></div>

<div><br>

</div>

<div>REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; <br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; MOLPROBITY STATISTICS.<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp; ALL-ATOM CLASHSCORE : 3.13<br>

RAMACHANDRAN PLOT:<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; OUTLIERS : 0.46&nbsp; %<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ALLOWED&nbsp; : 3.24&nbsp; %<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; FAVORED&nbsp; : 96.30 %<br>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>

</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><u>dev-2873:</u></div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>

</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; MOLPROBITY STATISTICS.<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; ALL-ATOM CLASHSCORE : 2.56<br>

<font color="FF0000">REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; MOLPROBITY SCORE&nbsp;&nbsp;&nbsp; : 1.24&nbsp; This line is missing from the newer version</font><br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; RAMACHANDRAN PLOT:<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; OUTLIERS : 0.46&nbsp; %<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ALLOWED&nbsp; : 2.78&nbsp; %<br>

REMARK&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; FAVORED&nbsp; : 96.76 %<br>

<br>

</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">I am just wondering whether this change is intentional.</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>

</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">&nbsp;&nbsp; Cheers,</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px"><br>

</div>

<div style="font-family:Tahoma; font-size:13px">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Boaz<br>

<div><font size="3" face="Times New Roman"></font>&nbsp;</div>

<div><font size="3" color="#000080" face="Times New Roman"><em>Boaz Shaanan, Ph.D.&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

<br>

Dept. of Life Sciences&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

Ben-Gurion University of the Negev&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

Beer-Sheva 84105&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

Israel&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

E-mail: bshaanan@bgu.ac.il<br>

Phone: 972-8-647-2220&nbsp;&nbsp;Skype: boaz.shaanan&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>

Fax:&nbsp;&nbsp; 972-8-647-2992 or 972-8-646-1710&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</em></font></div>

<div><font size="3" color="#000080" face="Times New Roman"><em></em></font>&nbsp;</div>

<div><font size="3" color="#000080" face="Times New Roman"><em></em></font>&nbsp;</div>

<div><font size="3" face="Times New Roman"><em><font color="#000080">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;

<br>

<br>

</font></em></font></div>

<font size="3" face="Times New Roman"></font></div>

</div>

</div>

</body>

</html>