<html>
  <head>

    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    This message is especially directed towards the membrane proteins
    community.<br>
    <br>
    <br>
    Dear everyone, <br>
    <br>
    we are very pleased to announce the release of the Detergent Belt
    Server -&gt;    <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://detbelt.ibcp.fr">http://detbelt.ibcp.fr</a><br>
    <br>
    Following our discovery of a method to quantify detergents around
    membrane proteins, we have build the detbelt server to allow for a
    simple <u>representation of the detergent belt around your protein
      of interest</u>. This representation is a simple approximation and
    grants a rapid estimation of the detergent belt, especially fitted
    to <u>biochemists</u> to better understand what is going on in your
    test tube. (Details on the server and the publication of the
    detergent quantification method are available on the tutorial page).<br>
    <br>
    The server allows you to play with different detergents
    interactively by recomputing the belt in your web browser, which
    allows you to refine your biochemical hypothesis. The server allows
    you to add several detergents, each with different values, and will
    compute the volume associated with these detergents mixtures. It
    outputs different metrics making it easier to compare
    detergent-occupied volumes, and a PyMOL script to generate a
    publication quality image. <br>
    <br>
    <br>
    For the moment, membrane protein pdb file should be pre-oriented
    using the PPM server procedure as it runs slow on the server; please
    visit the tutorial web page for more details (see "1"). We are
    working towards speeding up this process and making it all
    integrated in the near future. For testing purposes, I attach a
    pre-oriented pdb so that you can have an idea of the information you
    can obtain. <br>
    <br>
    Finally, we welcome any feedback to this alpha release; we welcome
    bug reports as well as creative feedback: if you think this tool has
    some potential for your research, please contact us and we will see
    what can be done. <br>
    <br>
    Wishing you good visualization<br>
    All the best<br>
    The DetBelt team<br>
    <br>
    <br>
    <div class="moz-signature">-- <br>
      <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
      <meta http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">
      <title></title>
      <meta name="Generator" content="Cocoa HTML Writer">
      <meta name="CocoaVersion" content="1348.17">
      <style type="text/css">
    p.p1 {margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 12.0px Helvetica; color: #000000; -webkit-text-stroke: #000000}
    span.s1 {font-kerning: none}
  </style>
      <p class="p1"><span class="s1">Vincent Chaptal, PhD</span></p>
      <p class="p1"><span class="s1">Institut de Biologie et Chimie des
          Protéines</span></p>
      <p class="p1"><span class="s1">Drug Resistance and Membrane
          Proteins Laboratory</span></p>
      <p class="p1"><span class="s1">7 passage du Vercors<span
            class="Apple-converted-space"> </span></span></p>
      <p class="p1"><span class="s1">69007 LYON</span></p>
      <p class="p1"><span class="s1">FRANCE</span></p>
      <p class="p1"><span class="s1">+33 4 37 65 29 01</span></p>
      <p class="p1"><span class="s1"><a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.ibcp.fr">http://www.ibcp.fr</a></span></p>
      <p class="p1"><span class="s1"><br>
        </span></p>
    </div>
  </body>
</html>