
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 TRANSITIONAL//EN">

<HTML>

<HEAD>

  <META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; CHARSET=UTF-8">

  <META NAME="GENERATOR" CONTENT="GtkHTML/3.32.2">

</HEAD>

<BODY>

Hello,<BR>

<BR>

I have several data sets which seem to loose completeness in their high-resolution shells when the HKL *.sca file is converted into an MTZ.&nbsp; I am using the recommended Diederichs CC1/2 cut off of 0.5, which is usually an I/s &lt;2.&nbsp; I also have an usually high redundancy in these data sets, not sure if that has any effect.&nbsp; Here is a typical comparison of the Phenix statistics and the HKL values.&nbsp; Note that the resolution bins do not match, and that the Phenix refinement was truncated to 3.0&#197;.<BR>

<BR>

&nbsp; PHENIX&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; HKL2000/Scalepack<BR>

<TT> RESOLUTION RANGE COMPL total&nbsp;&nbsp; CC1/2&nbsp;&nbsp; CC*&nbsp;&nbsp; Redn&nbsp; ScP-Angstrom </TT><BR>

<TT>50.1353 -&nbsp; 8.8720&nbsp;&nbsp; 97&nbsp;&nbsp; 97.8</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.989&nbsp; 0.997&nbsp; 10.9&nbsp; 70.00&nbsp;&nbsp; 7.87</TT><BR>

<TT> 8.8720 -&nbsp; 7.0483&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 7.0483 -&nbsp; 6.1591&nbsp; 100</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 99.6</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.990&nbsp; 0.997&nbsp; 12.8&nbsp;&nbsp; 7.87&nbsp;&nbsp; 6.25</TT><BR>

<TT> 6.1591 -&nbsp; 5.5968&nbsp; 100&nbsp;&nbsp; 99.7</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.991&nbsp; 0.998&nbsp; 12.9&nbsp;&nbsp; 6.25&nbsp;&nbsp; 5.46</TT><BR>

<TT> 5.5968 -&nbsp; 5.1961&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 5.1961 -&nbsp; 4.8900&nbsp;&nbsp; 99</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 99.6</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.991&nbsp; 0.998&nbsp; 13.0&nbsp;&nbsp; 5.46&nbsp;&nbsp; 4.96</TT><BR>

<TT> 4.8900 -&nbsp; 4.6453&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; 99.5</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.986&nbsp; 0.996&nbsp; 12.9&nbsp;&nbsp; 4.96&nbsp;&nbsp; 4.60</TT><BR>

<TT> 4.6453 -&nbsp; 4.4432&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; 99.2</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.990&nbsp; 0.997&nbsp; 13.1&nbsp;&nbsp; 4.60&nbsp;&nbsp; 4.33</TT><BR>

<TT> 4.4432 -&nbsp; 4.2723&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 4.2723 -&nbsp; 4.1249&nbsp;&nbsp; 99</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 99.8</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.988&nbsp; 0.997&nbsp; 13.3&nbsp;&nbsp; 4.33&nbsp;&nbsp; 4.11</TT><BR>

<TT> 4.1249 -&nbsp; 3.9960&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; 99.9</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.989&nbsp; 0.997&nbsp; 13.4&nbsp;&nbsp; 4.11&nbsp;&nbsp; 3.94</TT><BR>

<TT> 3.9960 -&nbsp; 3.8818&nbsp;&nbsp; 99&nbsp;&nbsp; 99.9</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.987&nbsp; 0.997&nbsp; 13.5&nbsp;&nbsp; 3.94&nbsp;&nbsp; 3.78</TT><BR>

<TT> 3.8818 -&nbsp; 3.7796&nbsp; 100&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 3.7796 -&nbsp; 3.6875&nbsp; 100</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 99.8</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.985&nbsp; 0.996&nbsp; 13.4&nbsp;&nbsp; 3.78&nbsp;&nbsp; 3.65</TT><BR>

<TT> 3.6875 -&nbsp; 3.6037&nbsp; 100&nbsp; 100.0</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.975&nbsp; 0.994&nbsp; 13.5&nbsp;&nbsp; 3.65&nbsp;&nbsp; 3.54</TT><BR>

<TT> 3.6037 -&nbsp; 3.5270&nbsp; 100&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 3.5270 -&nbsp; 3.4565&nbsp; 100</TT>&nbsp;&nbsp; <TT>100.0</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.964&nbsp; 0.991&nbsp; 13.5&nbsp;&nbsp; 3.54&nbsp;&nbsp; 3.44</TT><BR>

<TT> 3.4565 -&nbsp; 3.3912&nbsp; 100&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 3.3912 -&nbsp; 3.3307&nbsp;&nbsp; 97</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 99.9</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.966&nbsp; 0.991&nbsp; 12.1&nbsp;&nbsp; 3.44&nbsp;&nbsp; 3.35</TT><BR>

<TT> 3.3307 -&nbsp; 3.2742&nbsp;&nbsp; 87&nbsp; 100.0&nbsp;&nbsp; 0.916&nbsp; 0.978&nbsp; 10.2&nbsp;&nbsp; 3.35&nbsp;&nbsp; 3.27</TT><BR>

<TT> 3.2742 -&nbsp; 3.2214&nbsp;&nbsp; 68&nbsp; 100.0</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.857&nbsp; 0.961&nbsp;&nbsp; 8.5&nbsp;&nbsp; 3.27&nbsp;&nbsp; 3.19</TT><BR>

<TT> 3.2214 -&nbsp; 3.1719&nbsp;&nbsp; 54&nbsp;&nbsp; -</TT><BR>

<TT> 3.1719 -&nbsp; 3.1252&nbsp;&nbsp; 41</TT>&nbsp;&nbsp; <TT>100.0</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.763&nbsp; 0.930&nbsp;&nbsp; 7.4&nbsp;&nbsp; 3.19&nbsp;&nbsp; 3.12</TT><BR>

<TT> 3.1252 -&nbsp; 3.0812&nbsp;&nbsp; 33&nbsp;&nbsp; 99.9</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp; <TT>0.616&nbsp; 0.873&nbsp;&nbsp; 6.4&nbsp;&nbsp; 3.12&nbsp;&nbsp; 3.06</TT><BR>

<TT> 3.0812 -&nbsp; 3.0396&nbsp;&nbsp; 24&nbsp;&nbsp;</TT>&nbsp;&nbsp; <TT>-</TT><BR>

<TT> 3.0396 -&nbsp; 3.0001&nbsp;&nbsp; 18</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 98.4</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT> 0.547&nbsp; 0.841&nbsp;&nbsp; 5.8&nbsp;&nbsp; 3.06&nbsp;&nbsp; 3.00</TT><BR>

<TT>&nbsp;</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 95.1&nbsp;&nbsp; 0.307&nbsp; 0.685&nbsp;&nbsp; 5.2&nbsp;&nbsp; 3.00&nbsp;&nbsp; 2.95</TT><BR>

<TT>&nbsp;</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 89.8&nbsp;&nbsp; 0.302&nbsp; 0.681&nbsp;&nbsp; 4.8&nbsp;&nbsp; 2.95&nbsp;&nbsp; 2.90</TT><BR>

<TT>&nbsp;</TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;<TT>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 98.9&nbsp;&nbsp; 0.982&nbsp; 0.995&nbsp; 10.9&nbsp;&nbsp; All reflect. </TT><BR>

<TABLE CELLSPACING="0" CELLPADDING="0" WIDTH="100%">

<TR>

<TD>

-- <BR>

Yours sincerely, <BR>

<BR>

Mark A. White, Ph.D. <BR>

Associate Professor of Biochemistry and Molecular Biology, <BR>

Manager, Sealy Center for Structural Biology and Molecular Biophysics <BR>

Macromolecular X-ray Laboratory, <BR>

Basic Science Building, Room 6.658A <BR>

University of Texas Medical Branch <BR>

Galveston, TX 77555-0647 <BR>

Tel. (409) 747-4747 <BR>

mailto://mawhite@utmb.edu <BR>

http://xray.utmb.edu <BR>

<BR>

QQ: &quot;Don&#8217;t persist in folly. Some people commit themselves to their errors. They commit one error and consider it constancy to go on that way.&quot; <BR>

- Baltasar Gracian (1658) <BR>

<BR>

</TD>

</TR>

</TABLE>

</BODY>

</HTML>