<div dir="ltr"><div>Dear Oli,</div><div><br></div><div>The d99 criterion is available in the phenix.mtriage program.</div><div><br></div><div>Best wishes,<br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><br>--<br>Ricardo Diogo Righetto<br></div></div>
<br><div class="gmail_quote">2018-05-26 20:44 GMT+02:00 Oliver Clarke <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:olibclarke@gmail.com" target="_blank">olibclarke@gmail.com</a>&gt;</span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi,<br>
<br>
I think the “d99” criterion described in this preprint (<a href="https://www.biorxiv.org/content/early/2018/03/14/279844" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.biorxiv.org/<wbr>content/early/2018/03/14/<wbr>279844</a>) looks like a really interesting FSC-independent way to measure res in real space, and I’d like to give it a go on my maps (particularly those where I am suspicious of the FSC-based res based on map appearance, or where I suspect overfitting).<br>
<br>
Is it available in any phenix package at present? The scripts site mentioned in the preprint (<a href="http://phenix-online.org/phenix_data/afonine/cryoem_validation/" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/<wbr>phenix_data/afonine/cryoem_<wbr>validation/</a>) is currently rather sparsely populated.<br>
<br>
(Also, I wonder whether a directional version of the d99 criterion might be useful to estimate anisotropic res in the case of a preferred orientation, analogous to the 3D-FSC approach of Yong-Zi Tan and Dmitry Lyumkis?)<br>
<br>
Cheers<br>
Oli<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/<wbr>mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org">phenixbb-leave@phenix-online.<wbr>org</a></blockquote></div><br></div>