<div dir="ltr">Phoebe<div><br></div><div>Can I have the model? Or the first two bases?</div><div><br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr">Cheers<div><br></div><div>Nigel<div><br></div><div>---</div><div>Nigel W. Moriarty<br>Building 33R0349, Molecular Biophysics and Integrated Bioimaging</div><div>Lawrence Berkeley National Laboratory<br>Berkeley, CA 94720-8235<br>Phone : 510-486-5709     Email : NWMoriarty@LBL.gov<br>Fax   : 510-486-5909       Web  : <a href="http://CCI.LBL.gov" target="_blank">CCI.LBL.gov</a></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Oct 24, 2018 at 2:17 PM Phoebe A. Rice &lt;<a href="mailto:price@uchicago.edu">price@uchicago.edu</a>&gt; wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="m_6435886917697568528WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">A question from my collaborators: what is the best way to get phenix to handle a GTP as nt #1 of an RNA chain?   That is, what is the best way to specify a covalent bond with the proper geometry between the
 3’ O of GTP1 and the 5’ P of nt #2?<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Thanks in advance,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">  Phoebe <u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Phoebe A. Rice<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">Dept. of Biochem &amp; Mol. Biol. and<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt">  Committee on Microbiology<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><a href="https://voices.uchicago.edu/phoebericelab/" target="_blank"><span style="color:#0563c1">https://voices.uchicago.edu/phoebericelab/</span></a><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt"><u></u> <u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
phenixbb mailing list<br>
<a href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a><br>
<a href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" rel="noreferrer" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a><br>
Unsubscribe: <a href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></blockquote></div>