<div dir="ltr">Dear Edwin,<div> <br></div><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div></div><div>The alternative is probably to define the second orientation as an alternative conformation.  Aside from aesthetic objections, I don&#39;t want to lose the ability to restrain NCS - I need two orientations to be identical structures, and I am not sure yet whether I can use NCS groups defined via alternative conformers.</div></div></div></blockquote><div><br></div><div>I think this would be the easiest way forward and it looks like a very natural use of alternative conformations. You can definitely define NCS groups and even automatic search works. I&#39;m attaching a small dummy example I experimented on. Two overlapping helices: chain A with altloc A and occupancy 0.5, chain B with altloc B and occupancy 0.5. Nothing prevents you from defining NCS groups using &quot;altloc A&quot; and it should work, but I imagine there should always be equivalent selection in terms of &quot;chain A&quot;.</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Oleg Sobolev.</div><div><br></div></div></div></div>