<pre>
<B><FONT COLOR="#FF0000">
<html><!-- PHENIX HTML LOGFILE -->

##########################################################################################
##########################################################################################
##########################################################################################
### PHENIX: Phaser                                                               2.8.2 ###
##########################################################################################
User:         alexandradeaconescu
Run time:     Wed Mar 13 16:36:56 2019
Version:      2.8.2
Release Date: Tue Sep 11 23:43:46 2018 (svn 8390) (git 7416, c8943d3... )

If you use this software please cite:
"Phaser Crystallographic Software"
A.J. McCoy, R.W. Grosse-Kunstleve, P.D. Adams, M.D. Winn, L.C. Storoni & R.J. Read
J. Appl. Cryst. (2007). 40, 658-674
<a href="http://journals.iucr.org/j/issues/2007/04/00/he5368/he5368.pdf">PDF</a>

<!--END--></FONT></B>

******************************************************************************************
*** Phaser Module: PREPROCESSOR                                                  2.8.2 ***
******************************************************************************************

CELL 87.487 214.254 95.92 90 99.692 90
COMPOSITION BY ASU
COMPOSITION PROTEIN MW 140000 NUM 2
ELLG HIRES ON
ENSEMBLE FebMap HKLIN &
"/Users/alexandradeaconescu/Documents/DataProcessing/phenix/pAD6DNA/cut_out_density_60/pAD6DNA_cut_out_density_60.mtz" &
F = FWT PHI = PHWT EXTENT 80 112 150 RMS 4 CENTRE 150 150 144 PROTEIN MW 0.9 NUCLEIC MW 0.1
ENSEMBLE FebMap ESTIMATOR oeffner
HKLOUT ON
INFORMATION OFF
KEYWORDS OFF
LABIN I = I SIGI = SIGI
MACMR PROTOCOL CUSTOM
MACMR ROT ON  TRA ON  BFAC ON  VRMS ON  CELL ON  OFAC ON  LAST ON SIGROT 0 SIGTRA 0 NCYCLE 50 MINIMIZER BFGS
PEAKS ROT SELECT PERCENT CUTOFF 75
PEAKS TRA SELECT PERCENT CUTOFF 75
PURGE ROT PERCENT 75
PURGE TRA PERCENT 75
PURGE RNP PERCENT 75
RESHARPEN PERCENTAGE 100
RESOLUTION HIGH 7.5
RESOLUTION AUTO HIGH 7.5
ROOT "pAD6DNA_phaser"
SEARCH ENSEMBLE FebMap 
SEARCH ENSEMBLE FebMap 
SGALT BASE  P 2yb
SOLPAR SIGA FSOL 0.300 BSOL 501.605
SOLPAR BULK USE OFF
SPACEGROUP P 1 21 1
TITLE search for two molecules
TNCS RLIST ADD ON
XYZOUT ON

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 0.02 secs (      0.02 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:36:56 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: AUTOMATED MOLECULAR REPLACEMENT                               2.8.2 ***
******************************************************************************************

** Steps:
**    Cell Content Analysis
**    Anisotropy correction
**    Translational NCS correction
**    Rotation Function
**    Translation Function
**    Packing
**    Refinement
**    Final Refinement (if data higher resolution than search resolution)
** Number of search ensembles = 2
** Search Method: FAST
** Input Search Order:
**    #1   FebMap  
**    #2   FebMap  
** Automatic (best predicted) search order WILL be used

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 0.04 secs (      0.04 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:36:56 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: CELL CONTENT ANALYSIS                                         2.8.2 ***
******************************************************************************************

   Space-Group Name (Hall Symbol): P 1 21 1 ( P 2yb)
   Space-Group Number: 4
   Unit Cell:   87.49  214.25   95.92   90.00   99.69   90.00

--------------------
SPACE GROUP ANALYSIS
--------------------

   Input Space Group: P 1 21 1

   (a) Space groups derived by translation (screw) symmetry
   --------------------------------------------------------
   Z   Space Group    Hall Symbol
   ----
   2   P 1 21 1       P 2yb
       P 1 2 1        P 2y
   ----

   (b) Subgroups of space group for perfect twinning expansions
   ------------------------------------------------------------
   R: Reindexing operation required (*)
   Only subgroups related by rotational symmetry are reported
   Z   Space Group   R Hall Symbol
   ----
   1   P 1             P 1
   ---
   2   P 1 21 1        P 2yb
       P 1 2 1         P 2y
   ----

   Composition is of type: PROTEIN
   MW to which Matthews applies: 280000
   Resolution for Matthews calculation:  3.95

   Z       MW         VM    % solvent  rel. freq.
   1       280000     3.16  61.14      1.000       <== most probable
   2       560000     1.58  22.27      0.018     

   Z is the number of multiples of the total composition
   In most cases the most probable Z value should be 1
   If it is not 1, you may need to consider other compositions

   Histogram of relative frequencies of VM values
   ----------------------------------------------
   Frequency of most common VM value normalized to 1
   VM values plotted in increments of 1/VM (0.02)

        <--- relative frequency --->
        0.0  0.1  0.2  0.3  0.4  0.5  0.6  0.7  0.8  0.9  1.0  
        |    |    |    |    |    |    |    |    |    |    |    
   10.00 -
    8.33 -
    7.14 -
    6.25 -
    5.56 -
    5.00 -
    4.55 --
    4.17 --
    3.85 ----
    3.57 ------
    3.33 ----------
    3.12 *************** (COMPOSITION*1)
    2.94 ---------------------
    2.78 ----------------------------
    2.63 -----------------------------------
    2.50 -------------------------------------------
    2.38 ------------------------------------------------
    2.27 --------------------------------------------------
    2.17 ------------------------------------------------
    2.08 -----------------------------------------
    2.00 ------------------------------
    1.92 -------------------
    1.85 ----------
    1.79 -----
    1.72 --
    1.67 -
    1.61 -
    1.56 * (COMPOSITION*2)
    1.52 -
    1.47 -
    1.43 -
    1.39 -
    1.35 -
    1.32 -
    1.28 -
    1.25 -

   Most probable VM for resolution = 2.27337
   Most probable MW of protein in asu for resolution = 389797

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 0.08 secs (      0.08 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:36:56 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: ANISOTROPY CORRECTION                                         2.8.2 ***
******************************************************************************************

------------------------------
DATA FOR ANISOTROPY CORRECTION
------------------------------

   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Selected Data (Number):   3.95  47.28 (30491)

   Outlier Rejection
   -----------------
   There were 2 reflections of 30518 (0.0066%) rejected as outliers
      - outliers with a Wilson probability less than 1e-06
      - measurements expected to contain fewer than 0.01 bits of information

      H    K    L   reso        Eo^2       sigma probability  wilson low-info
     -5    6    7  11.06      14.363       0.413   6.297e-07  true   false   
      0    6    0  35.71      17.255       0.595   3.831e-08  true   false   

---------------------
ANISOTROPY CORRECTION
---------------------

   Protocol cycle #1 of 3
   Refinement protocol for this macrocycle:
   BIN SCALES: REFINE
   ANISOTROPY: REFINE
   SOLVENT K:  FIX
   SOLVENT B:  FIX

   Protocol cycle #2 of 3
   Refinement protocol for this macrocycle:
   BIN SCALES: REFINE
   ANISOTROPY: REFINE
   SOLVENT K:  FIX
   SOLVENT B:  FIX

   Protocol cycle #3 of 3
   Refinement protocol for this macrocycle:
   BIN SCALES: REFINE
   ANISOTROPY: REFINE
   SOLVENT K:  FIX
   SOLVENT B:  FIX

   Outlier Rejection
   -----------------
   There were 2 reflections of 30518 (0.0066%) rejected as outliers
      - outliers with a Wilson probability less than 1e-06
      - measurements expected to contain fewer than 0.01 bits of information

      H    K    L   reso        Eo^2       sigma probability  wilson low-info
     -5    6    7  11.06      14.363       0.413   6.297e-07  true   false   
      0    6    0  35.71      17.255       0.595   3.831e-08  true   false   

   Performing Optimization...
      Done
   --- Convergence before iteration limit (50) at cycle 19 ---
   Start-this-macrocycle End-this-macrocycle Change-this-macrocycle
     -151293.601           -150539.140               754.460

   Principal components of anisotropic part of B affecting observed amplitudes:
     eigenB (A^2)     direction cosines (orthogonal coordinates)
        14.027              0.0000   1.0000   0.0000
        10.518             -0.2025   0.0000   0.9793
       -24.545              0.9793   0.0000   0.2025
   Anisotropic deltaB (i.e. range of principal components):  38.571

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

   Performing Optimization...
      Done
   --- Convergence before iteration limit (50) at cycle 2 ---
   Start-this-macrocycle End-this-macrocycle Change-this-macrocycle
     -150570.257           -150569.740                 0.517

   Principal components of anisotropic part of B affecting observed amplitudes:
     eigenB (A^2)     direction cosines (orthogonal coordinates)
        14.034              0.0000   1.0000   0.0000
        10.507             -0.2021   0.0000   0.9794
       -24.542              0.9794   0.0000   0.2021
   Anisotropic deltaB (i.e. range of principal components):  38.576

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

   Performing Optimization...
      Done
   --- Convergence before iteration limit (50) at cycle 1 ---
   Start-this-macrocycle End-this-macrocycle Change-this-macrocycle
     -150569.740           -150569.740                 0.000

   Principal components of anisotropic part of B affecting observed amplitudes:
     eigenB (A^2)     direction cosines (orthogonal coordinates)
        14.035              0.0000   1.0000   0.0000
        10.507             -0.2021   0.0000   0.9794
       -24.542              0.9794   0.0000   0.2021
   Anisotropic deltaB (i.e. range of principal components):  38.576

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

   Refined Anisotropy Parameters
   -----------------------------
   Principal components of anisotropic part of B affecting observed amplitudes:
     eigenB (A^2)     direction cosines (orthogonal coordinates)
        14.035              0.0000   1.0000   0.0000
        10.507             -0.2021   0.0000   0.9794
       -24.542              0.9794   0.0000   0.2021
   Anisotropic deltaB (i.e. range of principal components):  38.576

--------------
ABSOLUTE SCALE
--------------

   Scale factor to put input Fs on absolute scale
   Wilson Scale:    56.3534
   Wilson B-factor: 142.938

--------------------------------
DATA AFTER ANISOTROPY CORRECTION
--------------------------------

   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Selected Data (Number):   3.95  47.28 (30493)

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

------------
OUTPUT FILES
------------

   No files output

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 8.13 secs (      8.13 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:37:04 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: TRANSLATIONAL NON-CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY                   2.8.2 ***
******************************************************************************************

   Unit Cell:   87.49  214.25   95.92   90.00   99.69   90.00

---------------------
MAXIMUM NMOL ANALYSIS
---------------------

   Stoichiometry of search components:
      "FebMap"

   Molecular weight of components:  1
   Volume of asymmetric unit:       886152
   Packing to solvent content:      20%
   Maximum automatic NMOL number:   576359

-------------------------------------
DATA FOR TRANSLATIONAL NCS CORRECTION
-------------------------------------

   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Selected Data (Number):   3.95  47.28 (30491)

   Outlier Rejection
   -----------------
   There were 2 reflections of 30518 (0.0066%) rejected as outliers
      - outliers with a Wilson probability less than 1e-06
      - measurements expected to contain fewer than 0.01 bits of information

      H    K    L   reso        Eo^2       sigma probability  wilson low-info
     -5    6    7  11.06      14.363       0.413   6.297e-07  true   false   
      0    6    0  35.71      17.255       0.595   3.831e-08  true   false   

   Weighted Intensity Moments for Data
   -----------------------------------
   Inverse variance-weighted 2nd Moment = <wE^4>/<wE^2>^2 == <wJ^2>/<wJ>^2
                        Untwinned   Perfect Twin
   2nd Moment  Centric:    3.0          2.0
   2nd Moment Acentric:    2.0          1.5
                               Measured
   2nd Moment  Centric:             2.70
   2nd Moment Acentric:             2.28

   Resolution for Twin Analysis (85% I/SIGI > 3):  3.95A (HiRes= 3.95A)

---------------------
ANISOTROPY CORRECTION
---------------------

   Weighted Intensity Moments after Anisotropy Correction
   ------------------------------------------------------
   Inverse variance-weighted 2nd Moment = <wE^4>/<wE^2>^2 == <wJ^2>/<wJ>^2
                        Untwinned   Perfect Twin
   2nd Moment  Centric:    3.0          2.0
   2nd Moment Acentric:    2.0          1.5
                               Measured
   2nd Moment  Centric:             2.57
   2nd Moment Acentric:             2.21

   Resolution for Twin Analysis (85% I/SIGI > 3):  3.95A (HiRes= 3.95A)

-----------------
TRANSLATIONAL NCS
-----------------

   tNCS vector not set
   Space Group (without translational symmetry):P 1 2 1
   Patterson Symmetry: P 1 2/m 1
   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Patterson (Number):       5.00  10.00 (13183)

   Raw Patterson Peaks Table
   -------------------------
   Sorted by Height
   Height Vector
   100.0%:   FRAC -0.0000 +0.0000 -0.0000   (ORTH   -0.0    0.0   -0.0)

   Patterson Top (All) = 9.23%
      There were 576 peaks

   Patterson Top (Non-origin) = 4.32%
      Patterson Origin Vector Distance = 15
      There were 568 non-origin peaks

   Patterson Top (Cutoff) = 0.00%
      Patterson cutoff = 20%
      There were 0 non-origin peaks over cutoff

   Patterson Top (Large Cell) = 0.00%
      Unit Cell dimension was not smaller than origin Patterson vector distance
      There were 0 non-origin and large cell peaks over cutoff

   Patterson Top (Analysis) = 0.00%
      Peaks within minimum Patterson vector distance of one another were deleted
      There were 0 widely separated non-origin peaks over cutoff

   There were no interesting non-origin Patterson peaks

   No tNCS found in Patterson

--------
TWINNING
--------

   tNCS/Twin Detection Table
   -------------------------
                                 -Second Moments-             --P-values--
                                 Centric Acentric       untwinned  twin frac < 5%
   Theoretical for untwinned      3.00    2.00    
     including measurement error  3.49    2.35    
   Theoretical for perfect twin   2.00    1.50    
   Initial (data as input)        2.70    2.28+/-0.028  1          1         
   After Anisotropy Correction    2.57    2.21+/-0.029  1          1         
   After Anisotropy and tNCS         ---n/a---

   P-value < 0.01 for < 5% twinned is considered worth investigating
   Resolution for Twin Analysis (85% I/SIGI > 3):  3.95A (HiRes= 3.95A)

---------------------------------------
DATA AFTER TRANSLATIONAL NCS CORRECTION
---------------------------------------

   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Selected Data (Number):   3.95  47.28 (30493)

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

------------
OUTPUT FILES
------------

   No files output

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 10.52 secs (     10.52 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:37:07 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: AUTOMATED MOLECULAR REPLACEMENT                               2.8.2 ***
******************************************************************************************

** Z-score test for definite solution is ON
** Z-score test for stopping search is OFF
** Deep search is ON

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 10.53 secs (     10.53 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:37:07 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: AUTOMATED MOLECULAR REPLACEMENT                               2.8.2 ***
******************************************************************************************

   Composition Table
   -----------------
   Total Scattering = 913019
   Search occupancy factor = 1 (default)
   Ensemble                       Frac.Scat. (Search Frac.Scat.) 
   FebMap                              0.00%               0.00%

** Composition not increased

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 10.53 secs (     10.53 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:37:07 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: EXPERIMENTAL ERROR CORRECTION PREPARATION                     2.8.2 ***
******************************************************************************************

-----------------
TRANSLATIONAL NCS
-----------------

   tNCS not present

-----------------------------
EXPERIMENTAL ERROR CORRECTION
-----------------------------

   Calculate Luzzati D factors accounting for observational error...

   Data have been provided as raw intensities

------------
OUTPUT FILES
------------

   No files output

CPU Time: 0 days 0 hrs 0 mins 11.92 secs (     11.92 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:37:08 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: EXPECTED LLG OF ENSEMBLES                                     2.8.2 ***
******************************************************************************************

-----------------
TRANSLATIONAL NCS
-----------------

   tNCS not present

   Resolution of Data (Selected):    3.950 (3.95002)
   Number of Reflections (Selected): 30518 (30493)
   eLLG Target: 225

----------
ENSEMBLING
----------

   Ensemble: FebMap
   ----------------
   MAP file # 1: pAD6DNA_cut_out_density_60.mtz
      This file contains 1 model
      The input RmsD of model #1 with respect to the real structure is 4.000

   Guide to eLLG values
   ---------------------
   eLLG      Top solution correct?
   <25       -no 
   25-36     -unlikely
   36-49     -possibly
   49-64     -probably
   >64       -yes

-----------------
POLY-ALANINE ELLG
-----------------

   Resolution = 3.95002
   Default RMSD = 0.1 0.2 0.4 0.8 1.6 3.2
   Minimum solvent = 20%
      Maximum number of polyalanine residues = 3231 (-full-)
   Alanine residues for eLLG target = 604

   Table of Alanine Residues for eLLG Target
   -----------------------------------------
                  ---RMSD--- 
   eLLG-target |  0.10  0.20  0.40  0.80  1.60  3.20 
           225 |   604   612   647   797  1540 -full-
           196 |   563   571   604   744  1437 -full-
           169 |   523   531   561   691  1335 -full-
           144 |   483   490   518   638  1232 -full-
           121 |   443   449   474   585  1129 -full-
           100 |   402   408   431   531  1027 -full-
            81 |   362   367   388   478   924  3064 
            64 |   322   326   345   425   821  2723 
            49 |   281   285   302   372   718  2383 
            36 |   241   245   259   319   616  2042 
            25 |   201   204   215   265   513  1702 
            16 |   161   163   172   212   410  1361 
             9 |   120   122   129   159   308  1021 
             4 |    80    81    86   106   205   680 
             1 |    40    40    43    53   102   340 

--------------
MONOMERIC ELLG
--------------

   Expected LLG (eLLG)
   -------------------
   eLLG: eLLG of ensemble alone
       eLLG   RMSD frac-scat  Ensemble
    0.00000  4.000   0.00000  FebMap

   Resolution for eLLG target
   --------------------------
   eLLG-reso: Resolution to achieve target eLLG (225)
     eLLG-reso  Ensemble
   > 3.95(all)  FebMap

   Resolution for eLLG target: data collection
   -------------------------------------------
   eLLG-reso: Resolution to achieve target eLLG (225) with perfect data
     eLLG-reso  Ensemble
        >1.2A   FebMap

------------------------------------------------------------------------------------------
Advisory: 
eLLG indicates that placement of a single copy of ensemble "FebMap" will be very difficult
------------------------------------------------------------------------------------------

   Expected LLG (eLLG): Chains
   ---------------------------
   eLLG: eLLG of chain alone
       eLLG   RMSD frac-scat chain  Ensemble

   Resolution for eLLG target: Chains
   ----------------------------------
   eLLG-reso: Resolution to achieve target eLLG (225)
     eLLG-reso chain  Ensemble

--------------------
HOMO-OLIGOMERIC ELLG
--------------------

   Number of copies for eLLG target
   --------------------------------
   eLLG-target   RMSD frac-scat-known frac-scat   num-copies  Ensemble
           225  4.000         1.00000   1.00000       276727  FebMap

CPU Time: 0 days 0 hrs 1 mins 32.45 secs (     92.45 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:38:29 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: AUTOMATED MOLECULAR REPLACEMENT                               2.8.2 ***
******************************************************************************************

** Search Order (next search *) (placed +):
**    #1   FebMap *
**    #2   FebMap  

CPU Time: 0 days 0 hrs 1 mins 32.46 secs (     92.46 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:38:29 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: MOLECULAR REPLACEMENT ROTATION FUNCTION                       2.8.2 ***
******************************************************************************************

-----------------
TRANSLATIONAL NCS
-----------------

   tNCS not present

--------------------------
DATA FOR ROTATION FUNCTION
--------------------------

   High resolution limit imposed by Maps =  7.77
   High resolution limit input =  7.77

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Selected Data (Number):   7.50  47.28 (4503)

-------------------
WILSON DISTRIBUTION
-------------------

   Parameters set for Wilson log-likelihood calculation
   E = 0 and variance 1 for each reflection
   Without correction for SigF to the variances,
      Wilson log(likelihood) = - number of acentrics (4280)
                               - half number of centrics (223/2)
                             = -4391
   With correction for SigF,
      Wilson log(likelihood) = -4456.78

----------
ENSEMBLING
----------

   Ensemble Generation: FebMap
   ---------------------------
   MAP file: pAD6DNA_cut_out_density_60.mtz
   Map LABIN F = FWT PHI = PHWT
   Ensemble configured to resolution  7.77

   Ensemble Generation
   -------------------
   Resolution of Ensembles: 7.76894
   Scat% Radius Model# Rel-B    RMS   DRMS   VRMS Ensemble                           
     0.0   57.0      1   0.0  4.000  0.000  4.000 FebMap                             

-----------------
ROTATION FUNCTION
-----------------

   Elmn for Search Ensemble
   Elmn Calculation for Search Ensemble
   0%                                                                               100%
   |================================================================================| DONE

   Target Function: FAST LERF1

-------------------------
ROTATION FUNCTION #1 OF 1
-------------------------

   Search Ensemble: FebMap

   Sampling:  3.91 degrees


   Spherical Harmonics
   -------------------
   Elmn for Data
   Elmn Calculation for Data
   0%                                                                             100%
   |==============================================================================| DONE

   Scanning the Range of Beta Angles
   ---------------------------------
   Clmn Calculation
   0%                                               100%
   |================================================| DONE

   Top Peaks Without Clustering
   Select peaks over 67.5% of top (i.e. 0.675*(top-mean)+mean)
      Also store peaks over 52.5% of top
   There were 2304 sites over 52.5% of top
   2304 peaks selected
   The sites over 52.5% are:
   #     Euler1 Euler2 Euler3    FSS   Z-score
   1      263.5   75.4  343.0    100.000  4.47
   2      262.8   75.7  341.1     93.863  4.20
   3      264.2   75.1  344.9     90.816  4.06
   #Sites = 2304: output truncated to 3 sites

   Top 2304 rotations before clustering will be rescored
   Calculating Likelihood for RF #1 of 1
   0%                                                                               100%
   |================================================================================| DONE

   Mean and Standard Deviation
   ---------------------------
   Scoring 500 randomly sampled rotations
   Generating Statistics for RF #1 of 1
   0%                                                                       100%
   |========================================================================| DONE

   Highest Score (Z-score):  439.475   ( 4.80)

   Top Peaks With Clustering
   Select peaks over 75% of top (i.e. 0.75*(top-mean)+mean)
      Also store peaks over 60% of top
   There were 125 sites over 60% of top
   The sites over 60% are:
   #     Euler1 Euler2 Euler3    LLG   Z-score Split #Group  FSS-this-ang/FSS-top
   1      256.2   32.1   88.6     439.48  4.80   0.0      1     68.312/    68.312
          283.8  147.9  268.6
   2      111.4   61.4  240.3     439.48  4.76  90.4      1     53.800/    53.800
           68.6  118.6   60.3
   3      121.1   72.7  230.7     439.48  4.52  99.0      3     61.367/    61.367
           58.9  107.3   50.7
   #SITES = 125: OUTPUT TRUNCATED TO 3 SITES

   Rotation Function Results
   Top1: ENSEMBLE FebMap EULER 256.222 32.110 88.645 RF=439.5 RFZ=4.80

   Rotation Function Table: FebMap
   -------------------------------
   (Z-scores from Fast Rotation Function)
   #SET        Top    (Z)      Second    (Z)       Third    (Z)
   1        439.48   4.80      439.48   4.76      439.48   4.52

---------------
FINAL SELECTION
---------------

   Select by Percentage of Top value: 75%
   Top RF = 439.475
   Purge RF mean = 439.475
   Number of sets stored before final selection = 1
   Number of solutions stored before final selection = 125
   Number of sets stored (deleted) after final selection = 1 (0)
   Number of solutions stored (deleted) after final selection = 125 (0)
   Percent used for purge = 60.000%
      Includes deep search down percent = 15%
      Number of solutions stored above (below) deep threshold = 32 (93)

   Rotation Function Final Selection Table
   ---------------------------------------
   Rotation list length by SET
   SET#  Start Final Deleted Set (*)   Deep: Start Final Deleted Set (*)
      1  32    32          -                 125   125         -
   ALL   32    32                            125   125  

------------
OUTPUT FILES
------------

   No files output

CPU Time: 0 days 0 hrs 1 mins 56.67 secs (    116.67 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:38:53 2019

******************************************************************************************
*** Phaser Module: MOLECULAR REPLACEMENT TRANSLATION FUNCTION                    2.8.2 ***
******************************************************************************************

-----------------
TRANSLATIONAL NCS
-----------------

   tNCS not present

-----------------------------
DATA FOR TRANSLATION FUNCTION
-----------------------------

   High Resolution Limit imposed by Maps =  7.77

   Outlier Rejection
   -----------------
   No reflections are outliers

   Resolution of All Data (Number):        3.95  47.28 (30518)
   Resolution of Selected Data (Number):   7.77  47.28 (4039)

-------------------
WILSON DISTRIBUTION
-------------------

   Parameters set for Wilson log-likelihood calculation
   E = 0 and variance 1 for each reflection
   Without correction for SigF to the variances,
      Wilson log(likelihood) = - number of acentrics (3830)
                               - half number of centrics (209/2)
                             = -3934
   With correction for SigF,
      Wilson log(likelihood) = -4017.3

------------------------
ALTERNATIVE SPACE GROUPS
------------------------

   Space Group(s) to be tested:
     P 1 21 1

----------
ENSEMBLING
----------

   Ensemble Generation
   -------------------
   Resolution of Ensembles: 7.76894
   Scat% Radius Model# Rel-B    RMS   DRMS   VRMS Ensemble                           
     0.0   57.0      1   0.0  4.000  0.000  4.000 FebMap                             

   Trace Generation: FebMap
   ------------------------
      This trace is from a map
   Performing Map FFT...
      Done

------------------------------------------------------------------------------------------
UNHANDLED ERROR: Program internal error in source file TraceMol.cc (line 229)
*** Consistency check (wang_mask.size()) failed. ***
Please email this log file with some supporting information and data to
cimr-phaser@lists.cam.ac.uk
------------------------------------------------------------------------------------------
--------------------
EXIT STATUS: FAILURE
--------------------

CPU Time: 0 days 0 hrs 1 mins 58.85 secs (    118.85 secs)
Finished: Wed Mar 13 16:38:55 2019

</pre>
</html>