<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Hello,<br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div style="font-size:12.7273px"><br></div></div></div></div></div><div><font color="#000000"><span style="font-size:12.7273px">I am refining a structure solved to 1.5A by MR. Rw/Rf were 0.17/0.22 which seem acceptable to me. At the very beginning part of the protein the electron density is a bit wobbly. I am able to build the residues into the positive densities. But after phenix.refine the chain always shifts away a bit and leaves the green blobs there. </span></font></div><div><br></div><div>(Photo: <a href="https://drive.google.com/open?id=1UngAJuEUt1S0LwPybMJLw2E1xA4cNM3R">https://drive.google.com/open?id=1UngAJuEUt1S0LwPybMJLw2E1xA4cNM3R</a>)<br></div><div><br></div><div>I am thinking if this can be solved by adjusting the target weights. Or can I apply certain restraints only to those few residues?</div><div><br></div><div>I refined XYZ (reciprocal space), XYZ (real space), individual B-factors, TLS and occupancies.</div><div><br></div><div>Thanks in advance.</div><div><br></div><div>Regards</div><div><br></div><div>Sam</div></div></div></div>