<div dir="ltr">Thank you for the clarification. <br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">El vie., 14 de jun. de 2019 a la(s) 14:50, Pavel Afonine (<a href="mailto:pafonine@lbl.gov">pafonine@lbl.gov</a>) escribió:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF">
    Hi Murpholino,<br>
    <br>
    reasons are similar to why crystallographic R factor never goes to
    zero.<br>
    <br>
    Model-map CC is calculated between the map (the data, in case of
    cryo EM, or sort of data in case of Crystallography) and a model. As
    you know data always has errors and model is just an approximation
    to reality. So you have no chance to match them perfectly, unless
    overfit. Something along these lines..<br>
    <br>
    Pavel<br>
    <br>
    <div class="gmail-m_1786256205274002230moz-cite-prefix">On 6/14/19 12:42, Murpholino Peligro
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      
      <div dir="ltr">
        <div>The links below show a plot of the results of
          phenix.real_space_correlation* for a nice lisozyme crystal and
          also the coot view.</div>
        <div><a href="https://drive.google.com/open?id=0B9tqXyDsq9YIdkRhcVFXU2dEdnhINXR6Y3hza2Y5NGpNM1hV" target="_blank">https://drive.google.com/open?id=0B9tqXyDsq9YIdkRhcVFXU2dEdnhINXR6Y3hza2Y5NGpNM1hV</a></div>
        <div><a href="https://drive.google.com/open?id=0B9tqXyDsq9YIREd1OFZhNGZtRnN4aldtVU1mdk84NExVX2Vn" target="_blank">https://drive.google.com/open?id=0B9tqXyDsq9YIREd1OFZhNGZtRnN4aldtVU1mdk84NExVX2Vn</a></div>
        <div><br>
        </div>
        <div>As you can see the electron density fits very well the
          model. <br>
        </div>
        <div>Why not a single residue gets a perfect correlation
          coefficient? (i.e. 1)</div>
        <div><br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Just curious. <br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>Thanks<br>
        </div>
        <div><br>
        </div>
        <div>
          <div><br>
          </div>
          <div>* phenix.real_space_correlation pdbfile mtzfile
            --detail=&quot;residue&quot; &gt; outpu</div>
        </div>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="gmail-m_1786256205274002230mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <pre class="gmail-m_1786256205274002230moz-quote-pre">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="gmail-m_1786256205274002230moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="gmail-m_1786256205274002230moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb" target="_blank">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
Unsubscribe: <a class="gmail-m_1786256205274002230moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org" target="_blank">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </div>

</blockquote></div>