<html>
  <head>
    <meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=UTF-8">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Hi Pramod,<br>
    <br>
    let's think of it this way.. Your experimental map (that you call a
    weird name "volume")  is the experimental data, or at least the data
    that is as close to experimental as you can get at this stage
    (unless you go back to 2D images).<br>
    <br>
    Now if you enforce symmetry on the data, that means you wipe out
    lower symmetry information, there is no obvious reason why atomic
    model that you fit into these data should deviate from the symmetry
    that you enforced on these data. <br>
    <br>
    So the answer is: if data was symmetrized (enforced to have a
    particular symmetry) then the mode MUST have that symmetry too. <br>
    <br>
    Phenix has tools to make sure this happens.<br>
    <br>
    Good luck,<br>
    Pavel<br>
    <br>
    <div class="moz-cite-prefix">On 7/26/19 13:46, pramod kumar wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite"
cite="mid:CAH3K_eyRKiooxh4Tgtve9HQmJh6i27ECodxEw98FnDRqHN+wpQ@mail.gmail.com">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=UTF-8">
      <div dir="ltr">
        <div><tt>Dear all,</tt></div>
        <div><tt><br>
          </tt></div>
        <div><tt>I have a query related to symmetry imposition and
            corresponding tweaking of model.</tt></div>
        <tt>
          <div><tt><br>
            </tt></div>
          If symmetry (say, C4) was imposed during the reconstruction of
          a 3D volume, does symmetry also need to be imposed when
          building the atomic model (say, in Phenix)? Or could this
          constrain be relaxed?</tt>
        <div><tt><br>
          </tt></div>
        <div><tt>Do we need to tweak the model in Coot for other chains
            or since it is build on symmetrical partners therefore
            should only be made in one chain and copied for all without
            any fitting?<br>
          </tt>
          <div><br>
          </div>
          <div><br>
          </div>
          Pramod Jaykar, Ph.D.</div>
        <div><br>
        </div>
        <br>
      </div>
      <br>
      <fieldset class="mimeAttachmentHeader"></fieldset>
      <pre class="moz-quote-pre" wrap="">_______________________________________________
phenixbb mailing list
<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb@phenix-online.org">phenixbb@phenix-online.org</a>
<a class="moz-txt-link-freetext" href="http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb">http://phenix-online.org/mailman/listinfo/phenixbb</a>
Unsubscribe: <a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:phenixbb-leave@phenix-online.org">phenixbb-leave@phenix-online.org</a></pre>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>