<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<meta content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body class="" style="word-wrap:break-word; line-break:after-white-space">
<div dir="auto">Hi,
<div dir="auto">Just insert these lines into the .eff file that you generated (through the gui) and execute the new .eff file. That's the simplest way to do this, I would think.</div>
<div dir="auto">Stay safe.</div>
<div dir="auto">Boaz<br>
<br>
<div dir="auto">Boaz Shaanan, Ph.D.<br>
Department of Life Sciences<br>
Ben Gurion University of the Negev<br>
Beer Sheva<br>
Israel</div>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Mar 27, 2020 15:42, Valerie Biou &lt;valerie.biou@ibpc.fr&gt; wrote:<br type="attribution">
</div>
</div>
<div>Hello
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I am trying to impose restraints on my lipid ligand during real space refinement. I found the command</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class=""><font face="Courier" class="">refinement.geometry_restraints.edits.scale_restraints {</font></div>
<div class=""><font face="Courier" class="">&nbsp; atom_selection = &quot;resname LLP&quot;</font></div>
<div class=""><font face="Courier" class="">&nbsp; scale = 2.5</font></div>
<div class=""><font face="Courier" class="">&nbsp; apply_to = *bond *angle dihedral chirality</font></div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I have 2 questions</div>
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>1) can those lines be called from the GUI and where? if not, how can I insert them in a previous command file?</div>
<div class=""><span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre"></span>2) what do the * stand for? is it to activate or cancel the selection of an item?</div>
<div class="">sorry if those questions have been asked before, I can't find the command to browse the bb archive.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">All the best,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class="" style="color:rgb(0,0,0); letter-spacing:normal; text-align:start; text-indent:0px; text-transform:none; white-space:normal; word-spacing:0px; word-wrap:break-word; line-break:after-white-space">
<div class="">ValĂ©rie&nbsp;</div>
</div>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</body>
</html>